168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1699 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 267 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  47.17 
 
 		 265 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  47.17 
 
 		 265 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  46.67 
 
 		 269 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  44.49 
 
 		 265 aa  218  6e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  47.51 
 
 		 265 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  41.89 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  44.4 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  46.67 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  43.07 
 
 		 272 aa  211  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  42.7 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  43.77 
 
 		 254 aa  209  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  43.56 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  42.32 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  41.64 
 
 		 265 aa  206  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  46.44 
 
 		 267 aa  205  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  44.15 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  45.15 
 
 		 268 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  40.82 
 
 		 272 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  47.21 
 
 		 268 aa  202  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  44.81 
 
 		 269 aa  201  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  41.04 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  41.04 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  42.7 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  40.23 
 
 		 271 aa  199  5e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  43.66 
 
 		 268 aa  198  9e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  42.32 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  40.46 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  41.33 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  41.11 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  41.29 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  42.96 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  42.96 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  42.54 
 
 		 265 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  44.44 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  40.81 
 
 		 269 aa  185  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  37.78 
 
 		 274 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  40.6 
 
 		 255 aa  180  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  36.33 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  38.17 
 
 		 252 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  38.17 
 
 		 252 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  37.97 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  35.98 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  35.29 
 
 		 284 aa  166  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  31.3 
 
 		 253 aa  165  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  35.23 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  33.21 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  33.85 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  35.5 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  36.26 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  32.44 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  34.35 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  34.96 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  31.44 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  33.97 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  33.08 
 
 		 257 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  34.35 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  33.98 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  30.42 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  31.56 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  32.44 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  29.52 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  33.21 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  28.9 
 
 		 254 aa  135  9e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  29.78 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  30.92 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  31.92 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  29.28 
 
 		 253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  30.53 
 
 		 253 aa  128  9.000000000000001e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  31.11 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  29.62 
 
 		 492 aa  111  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  31.15 
 
 		 245 aa  89.7  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  32.13 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  43.62 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  28.16 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  28.57 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  25.09 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  31.65 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2567  phosphonate metabolism protein, PhnP  31.64 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0979832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2878  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.32 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  39.39 
 
 		 240 aa  72  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.01 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  33.21 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  33.21 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  24.1 
 
 		 372 aa  68.9  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  26.75 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  25.18 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20450  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.94 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.214049  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.32 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.17 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.17 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2259  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.64 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.373165  normal  0.710906 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.47 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  32.8 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.99 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.11 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>