233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1261 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 254 aa  520  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  58.1 
 
 		 254 aa  301  9e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  48.83 
 
 		 255 aa  249  4e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  46.24 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  45.49 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  45.49 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  44.78 
 
 		 269 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  43.13 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  42.42 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  42.59 
 
 		 268 aa  193  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  43.68 
 
 		 268 aa  192  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  40.81 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  42.48 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  39.18 
 
 		 268 aa  186  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  38.82 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  38.01 
 
 		 284 aa  186  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  41.24 
 
 		 272 aa  184  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  39.92 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  38.43 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  38.95 
 
 		 272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  41.24 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  37.31 
 
 		 271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  37.83 
 
 		 265 aa  179  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  37.83 
 
 		 272 aa  178  5.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  37.83 
 
 		 272 aa  178  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  39.55 
 
 		 265 aa  178  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  38.67 
 
 		 251 aa  178  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  37.35 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  38.58 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  38.2 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  42.96 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  37.59 
 
 		 267 aa  174  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  40.23 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  37.12 
 
 		 284 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  40.23 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  36.09 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  37.97 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  38.58 
 
 		 274 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  37.59 
 
 		 270 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  36.84 
 
 		 274 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  41.25 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  39.31 
 
 		 266 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  41.86 
 
 		 251 aa  168  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  38.72 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  39.02 
 
 		 264 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  37.83 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  38.7 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  40.07 
 
 		 267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  39.92 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  39.53 
 
 		 251 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  34.12 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  38.11 
 
 		 262 aa  155  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  33.2 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  37.74 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  34.24 
 
 		 260 aa  151  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  34.62 
 
 		 270 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  35.69 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  33.08 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  33.98 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  39.31 
 
 		 257 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  34.36 
 
 		 254 aa  148  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  35.25 
 
 		 255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  33.98 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  32.71 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  32.32 
 
 		 254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  35 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  32.7 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  31.95 
 
 		 264 aa  135  4e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  33.85 
 
 		 254 aa  132  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  34.88 
 
 		 253 aa  131  7.999999999999999e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  33.96 
 
 		 492 aa  131  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  28.09 
 
 		 264 aa  121  9e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  30.08 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  28.63 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  34.34 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  46.46 
 
 		 100 aa  99.4  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  33.9 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  31.84 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  28.24 
 
 		 248 aa  92  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  28.78 
 
 		 266 aa  86.3  4e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  27.14 
 
 		 246 aa  85.5  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  30.91 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  30.1 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  26.58 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2686  phosphonate metabolism protein PhnP  26.04 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.78 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.78 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2567  phosphonate metabolism protein, PhnP  25.38 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0979832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.51 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.51 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3973  beta-lactamase domain-containing protein  29.81 
 
 		 252 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51250  hypothetical protein  30.54 
 
 		 252 aa  62  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188489 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2443  hypothetical protein  27.27 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3434  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2259  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.373165  normal  0.710906 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.42 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.42 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>