191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0199 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  100 
 
 
286 aa  587  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  54.76 
 
 
255 aa  279  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  54.37 
 
 
253 aa  279  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  55.16 
 
 
251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  49.6 
 
 
264 aa  267  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  48.41 
 
 
251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  54.37 
 
 
251 aa  266  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  53.99 
 
 
270 aa  264  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  52.78 
 
 
251 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  42.4 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  44.49 
 
 
253 aa  230  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  43.7 
 
 
252 aa  225  8e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  42.35 
 
 
260 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  41.67 
 
 
252 aa  223  2e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  40.89 
 
 
253 aa  219  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  44.44 
 
 
252 aa  217  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  44.44 
 
 
252 aa  217  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  46.96 
 
 
257 aa  216  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  40.93 
 
 
261 aa  210  2e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  40.78 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  39.36 
 
 
254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  41.6 
 
 
254 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  40.16 
 
 
253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  34.25 
 
 
254 aa  194  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  38.31 
 
 
255 aa  193  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  37.65 
 
 
254 aa  191  8e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  40.16 
 
 
253 aa  189  5e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  38.61 
 
 
268 aa  186  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  40.3 
 
 
267 aa  185  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  39.23 
 
 
265 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  39.23 
 
 
265 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  38.93 
 
 
269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  35.69 
 
 
253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  37.1 
 
 
253 aa  181  1e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  36.74 
 
 
284 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  36.12 
 
 
265 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  36.12 
 
 
272 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  36.15 
 
 
272 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  36.12 
 
 
272 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  34.21 
 
 
272 aa  175  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  39.25 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  37.64 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  36.96 
 
 
265 aa  169  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  34.34 
 
 
272 aa  168  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  34.08 
 
 
272 aa  168  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  34.34 
 
 
272 aa  168  8e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  35.74 
 
 
265 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  39.68 
 
 
492 aa  164  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  32.58 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  32.7 
 
 
267 aa  163  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  35.74 
 
 
266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  35.5 
 
 
265 aa  162  8.000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  34.21 
 
 
268 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  33.84 
 
 
266 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  39.46 
 
 
269 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  32.45 
 
 
274 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  34.31 
 
 
270 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  33.71 
 
 
267 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  32.7 
 
 
267 aa  158  8e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  33.84 
 
 
284 aa  156  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  33.08 
 
 
271 aa  155  7e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 
262 aa  155  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  36.86 
 
 
269 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  33.85 
 
 
267 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  33.2 
 
 
254 aa  154  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  33.86 
 
 
254 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  35.42 
 
 
266 aa  151  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  36.29 
 
 
255 aa  149  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  31.99 
 
 
272 aa  142  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  33.98 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  32.77 
 
 
264 aa  135  9.999999999999999e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  30.63 
 
 
264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  32.22 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  31 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  33.08 
 
 
267 aa  125  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  54 
 
 
100 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  32.7 
 
 
246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  28.73 
 
 
261 aa  112  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  28.46 
 
 
248 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  32.76 
 
 
245 aa  110  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  30.51 
 
 
239 aa  105  7e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  33.33 
 
 
260 aa  105  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  29.12 
 
 
240 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  31.68 
 
 
242 aa  102  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  29.37 
 
 
270 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  40.82 
 
 
150 aa  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.56 
 
 
250 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.56 
 
 
250 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.8 
 
 
250 aa  99  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0487  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  32.82 
 
 
265 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5605  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.85 
 
 
252 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  29.01 
 
 
239 aa  94.4  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2288  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  32.47 
 
 
255 aa  94.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.52798  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03964  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.35 
 
 
252 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3899  phosphonate metabolism protein PhnP  30.35 
 
 
252 aa  92  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3934  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.95 
 
 
252 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03924  hypothetical protein  30.35 
 
 
252 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2878  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  33.58 
 
 
254 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4558  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.35 
 
 
252 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>