143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0539 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 265 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  73.48 
 
 		 265 aa  414  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  60.23 
 
 		 269 aa  323  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  60.38 
 
 		 268 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  61.45 
 
 		 269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  55.89 
 
 		 265 aa  311  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  54.55 
 
 		 267 aa  310  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  54.75 
 
 		 267 aa  310  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  59.85 
 
 		 272 aa  308  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  59.85 
 
 		 272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  60.75 
 
 		 269 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  55.13 
 
 		 266 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  60.69 
 
 		 267 aa  301  9e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  56.87 
 
 		 265 aa  300  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  52.85 
 
 		 270 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  55.13 
 
 		 265 aa  296  3e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  53.61 
 
 		 266 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  52.47 
 
 		 267 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  57.14 
 
 		 268 aa  287  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  53.67 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  53.67 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  51.91 
 
 		 284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  51.12 
 
 		 272 aa  283  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  53.28 
 
 		 265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  49.43 
 
 		 272 aa  281  9e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  48.28 
 
 		 272 aa  275  7e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  48.28 
 
 		 272 aa  275  7e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  50.78 
 
 		 274 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  50.96 
 
 		 272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  50.39 
 
 		 274 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  50 
 
 		 272 aa  270  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  52.27 
 
 		 268 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  47.57 
 
 		 284 aa  259  4e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  50.38 
 
 		 266 aa  251  6e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  45.53 
 
 		 271 aa  241  7.999999999999999e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  42.54 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  41.89 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  42.47 
 
 		 252 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  42.47 
 
 		 252 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  39.55 
 
 		 254 aa  188  8e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  39.25 
 
 		 286 aa  185  7e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  39.93 
 
 		 267 aa  182  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  40 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  37.74 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  40.23 
 
 		 255 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  41.38 
 
 		 251 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  40.84 
 
 		 255 aa  178  8e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  40.52 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  42.53 
 
 		 264 aa  178  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  38.87 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  41.76 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  34.75 
 
 		 255 aa  165  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  37.93 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  40.68 
 
 		 251 aa  162  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  36.23 
 
 		 270 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  40.68 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  32.18 
 
 		 253 aa  159  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  33.71 
 
 		 253 aa  158  7e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  34.59 
 
 		 260 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  32.82 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  33.84 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  35.74 
 
 		 252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  35.27 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  32.95 
 
 		 254 aa  148  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  34.44 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  33.21 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  32.58 
 
 		 492 aa  137  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  30.15 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  32.44 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  31 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  32.6 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  31.8 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  29.48 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  28.52 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  43.14 
 
 		 100 aa  85.9  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  28.88 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  28.26 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  28.16 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  27.8 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  29.79 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01800  conserved hypothetical protein  26.54 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00595341  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  25.2 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  35.58 
 
 		 150 aa  67  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  27.73 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  28.3 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.82 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  27.08 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.6 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  26.15 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.6 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  25.21 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.37 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.37 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.47 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.52 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.47 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20450  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.77 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.214049  normal  0.511622 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>