198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0205 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
270 aa  546  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  49.81 
 
 
253 aa  265  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  53.99 
 
 
286 aa  264  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  46.09 
 
 
254 aa  257  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  46.95 
 
 
260 aa  250  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  44.36 
 
 
252 aa  247  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  44.14 
 
 
254 aa  245  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  45.7 
 
 
253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  46.69 
 
 
264 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  49.8 
 
 
251 aa  236  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  44.44 
 
 
253 aa  236  3e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  45.95 
 
 
255 aa  236  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  50 
 
 
252 aa  235  6e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  50 
 
 
252 aa  235  6e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  50 
 
 
251 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  44.19 
 
 
254 aa  229  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  44.53 
 
 
252 aa  230  2e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  44.96 
 
 
252 aa  229  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  44.71 
 
 
253 aa  229  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  45.95 
 
 
253 aa  228  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  49.02 
 
 
251 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  45.1 
 
 
251 aa  226  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  48.05 
 
 
257 aa  217  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  42.75 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  42.91 
 
 
254 aa  212  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  41.89 
 
 
261 aa  210  3e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  41.02 
 
 
253 aa  209  4e-53  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  41.98 
 
 
253 aa  203  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  45 
 
 
492 aa  202  6e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  40.93 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  42.97 
 
 
265 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  38.38 
 
 
272 aa  188  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  37.64 
 
 
272 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  37.64 
 
 
272 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  40.68 
 
 
265 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  41.51 
 
 
267 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  40.68 
 
 
265 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  39.63 
 
 
268 aa  186  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  41.6 
 
 
265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  39.93 
 
 
268 aa  182  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  38.95 
 
 
265 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  38.58 
 
 
269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  40.15 
 
 
259 aa  179  5.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  38.2 
 
 
272 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  36.63 
 
 
272 aa  176  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  37.5 
 
 
265 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  36.63 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  37.97 
 
 
269 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  35.61 
 
 
265 aa  169  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  39.08 
 
 
268 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  36.67 
 
 
272 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  35.07 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  34.69 
 
 
284 aa  162  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  35.14 
 
 
284 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  34.34 
 
 
274 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  37.12 
 
 
266 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  35.09 
 
 
267 aa  156  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  35.47 
 
 
270 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
271 aa  154  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  34.85 
 
 
266 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  33.96 
 
 
267 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  36.23 
 
 
265 aa  153  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  33.46 
 
 
272 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  36.33 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  34.62 
 
 
254 aa  151  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  34.96 
 
 
267 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  39.41 
 
 
269 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  32.83 
 
 
264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  31.94 
 
 
263 aa  139  7e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  32.57 
 
 
262 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  32.57 
 
 
254 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  33.58 
 
 
255 aa  135  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  30.71 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  31.92 
 
 
267 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  34.1 
 
 
267 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  58.59 
 
 
100 aa  123  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  49.64 
 
 
150 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  30.58 
 
 
266 aa  118  7.999999999999999e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  30.4 
 
 
261 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  32.68 
 
 
239 aa  112  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 
245 aa  112  9e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  29.12 
 
 
246 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  27.55 
 
 
248 aa  100  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  33.2 
 
 
242 aa  97.8  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20450  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  32.12 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.214049  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.4 
 
 
250 aa  97.1  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.37 
 
 
260 aa  96.7  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.37 
 
 
260 aa  96.7  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.4 
 
 
250 aa  96.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  27.8 
 
 
240 aa  95.9  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.85 
 
 
261 aa  95.5  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.85 
 
 
261 aa  95.5  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.75 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.41 
 
 
260 aa  92.4  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.3 
 
 
250 aa  92.4  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0487  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.57 
 
 
265 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0583  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.06 
 
 
257 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3434  beta-lactamase domain protein  29.48 
 
 
274 aa  90.1  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 
270 aa  89.7  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2878  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.91 
 
 
254 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>