156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2290 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  46.64 
 
 		 252 aa  235  6e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  45.28 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  44.88 
 
 		 251 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  41.18 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  41.18 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  40.55 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  41.73 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  37.55 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  38.82 
 
 		 253 aa  206  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  37.89 
 
 		 254 aa  205  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  41.96 
 
 		 255 aa  205  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  41.34 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  41.34 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  37.94 
 
 		 254 aa  202  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  40.64 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  41.25 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  40.78 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  40.93 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  44.88 
 
 		 251 aa  198  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  40.93 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  39.68 
 
 		 253 aa  195  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  43.53 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  39.92 
 
 		 254 aa  191  7e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  43.53 
 
 		 251 aa  191  9e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  39.37 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  42.31 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  42.31 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  41.98 
 
 		 272 aa  188  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  39.53 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  35.43 
 
 		 252 aa  185  7e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  40.47 
 
 		 265 aa  183  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  40.23 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  40.47 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  40.08 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  40.16 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  39.85 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  40.46 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  40.84 
 
 		 272 aa  178  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  39.31 
 
 		 265 aa  178  9e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  42.15 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  39.53 
 
 		 266 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  39.92 
 
 		 268 aa  175  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  39.08 
 
 		 284 aa  175  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  40.46 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  38.8 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  38.7 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  38.61 
 
 		 272 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  38.37 
 
 		 265 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  35.52 
 
 		 262 aa  168  7e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  39.13 
 
 		 492 aa  167  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  41.76 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  37.16 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  37.16 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  41 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  40.84 
 
 		 265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  37.69 
 
 		 270 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  37.26 
 
 		 267 aa  165  8e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  37.79 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  37.98 
 
 		 266 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  36.33 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  35.91 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  39.46 
 
 		 269 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  36.23 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  35.27 
 
 		 254 aa  154  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  39.84 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  35.09 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  34.35 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  35.11 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  35.25 
 
 		 254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  33.21 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  34.35 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  33.98 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  36.74 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  32.33 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  31.03 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  31.18 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  32.05 
 
 		 245 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  44.07 
 
 		 150 aa  105  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  45.92 
 
 		 100 aa  104  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  32.35 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  30.19 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  33.21 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  30.51 
 
 		 261 aa  99  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0583  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.64 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0487  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.97 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.26 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  29.92 
 
 		 239 aa  92.8  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  28.98 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  32.82 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20450  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  32.01 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.214049  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  32.23 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5605  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.68 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  26.58 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2686  phosphonate metabolism protein PhnP  27.57 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.2 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.2 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.47 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>