114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1988 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 274 aa  566  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  94.16 
 
 		 274 aa  540  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  70.41 
 
 		 272 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  67.65 
 
 		 284 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  62.92 
 
 		 272 aa  352  2.9999999999999997e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  59.92 
 
 		 272 aa  328  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  58.49 
 
 		 272 aa  325  5e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  58.49 
 
 		 272 aa  325  5e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  54.51 
 
 		 271 aa  308  6.999999999999999e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  50.38 
 
 		 265 aa  275  4e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  50.94 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  48.85 
 
 		 265 aa  272  5.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  47.69 
 
 		 267 aa  262  4.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  50.39 
 
 		 265 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  48.29 
 
 		 266 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  47.89 
 
 		 265 aa  259  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  50.57 
 
 		 268 aa  259  4e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  47.15 
 
 		 267 aa  258  6e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  46.24 
 
 		 265 aa  258  8e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  46.24 
 
 		 265 aa  258  8e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  46.74 
 
 		 267 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  44.74 
 
 		 265 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  45.59 
 
 		 266 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  45.77 
 
 		 270 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  45.9 
 
 		 269 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  48.85 
 
 		 269 aa  238  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  47.37 
 
 		 266 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  46.42 
 
 		 267 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  45.45 
 
 		 268 aa  234  9e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  45.35 
 
 		 268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  46.27 
 
 		 272 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  42.7 
 
 		 284 aa  232  6e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  44.81 
 
 		 272 aa  231  7.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  46.27 
 
 		 272 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  46.24 
 
 		 269 aa  227  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  41.15 
 
 		 255 aa  192  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  37.78 
 
 		 267 aa  182  7e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  36.7 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  37.79 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  37.79 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  40.08 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  37.22 
 
 		 254 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  36.84 
 
 		 254 aa  171  9e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  37.74 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  35.11 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  33.58 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  35.07 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  34.59 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  32.45 
 
 		 261 aa  161  8.000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  32.45 
 
 		 286 aa  161  9e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  34.7 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  35.11 
 
 		 251 aa  159  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  34.11 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  34.35 
 
 		 251 aa  156  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  35.36 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 		 253 aa  151  8.999999999999999e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  33.46 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  32.95 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  37.18 
 
 		 267 aa  149  5e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  33.84 
 
 		 253 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  32.45 
 
 		 253 aa  148  8e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  34.07 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  32.18 
 
 		 254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  32.58 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  32.09 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  30.66 
 
 		 492 aa  135  7.000000000000001e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  29.5 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  32.12 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  30.38 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  29.74 
 
 		 264 aa  131  9e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  32.95 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  30.12 
 
 		 253 aa  126  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  29.81 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  46.6 
 
 		 100 aa  104  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  28.83 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  24.59 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  28.28 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  32.86 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  26.64 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  24.8 
 
 		 240 aa  72  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01800  conserved hypothetical protein  26.13 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00595341  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  25.2 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  33.33 
 
 		 150 aa  67  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  26.75 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  23.44 
 
 		 239 aa  57  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3434  beta-lactamase domain protein  24.54 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  22.62 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.27 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 		 244 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2213  beta-lactamase domain protein  37.33 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.104031  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3684  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.36 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0583  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.28 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1173  beta-lactamase domain protein  26 
 
 		 246 aa  46.2  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0487  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.28 
 
 		 265 aa  45.8  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2288  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  24.91 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.52798  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>