148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2160 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  100 
 
 		 272 aa  557  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  70.79 
 
 		 274 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  70.41 
 
 		 274 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  67.91 
 
 		 284 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  64.26 
 
 		 272 aa  352  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  61.6 
 
 		 272 aa  344  8.999999999999999e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  60.75 
 
 		 272 aa  338  5.9999999999999996e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  60.75 
 
 		 272 aa  338  5.9999999999999996e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  55.97 
 
 		 271 aa  317  1e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  55.21 
 
 		 265 aa  287  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  53.64 
 
 		 265 aa  283  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  52.29 
 
 		 266 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  50 
 
 		 267 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  51.15 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  48.85 
 
 		 265 aa  266  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  52.06 
 
 		 268 aa  265  5e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  49.62 
 
 		 267 aa  265  8e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  50.19 
 
 		 267 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  50 
 
 		 265 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  50 
 
 		 265 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 265 aa  259  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  50.76 
 
 		 268 aa  258  9e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  49.81 
 
 		 266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  48.09 
 
 		 265 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  50.19 
 
 		 269 aa  249  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  50.38 
 
 		 272 aa  249  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  50.38 
 
 		 272 aa  248  7e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  48.09 
 
 		 270 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  49.24 
 
 		 267 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  48.31 
 
 		 266 aa  241  7e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  49.04 
 
 		 269 aa  241  9e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  43.01 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  44.98 
 
 		 272 aa  239  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  45.56 
 
 		 268 aa  238  8e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  47.89 
 
 		 269 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  40.98 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  41.33 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  41.06 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  41.06 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  38.85 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  40.45 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  37.26 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  35.77 
 
 		 252 aa  181  8.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  36.94 
 
 		 262 aa  181  8.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  39.38 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  37.26 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  39.85 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  39.54 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  36.15 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  38.2 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  38.2 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  36.88 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  35.36 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  37.26 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  37.26 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  34.83 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  37.97 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  33.7 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  34.11 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  33.59 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  32.2 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  32.06 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  36.5 
 
 		 252 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  33.21 
 
 		 254 aa  149  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  32.95 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  33.08 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  33.71 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  31.85 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  32.97 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  31.8 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  32.49 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  31.56 
 
 		 492 aa  128  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  28.32 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  50.49 
 
 		 100 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  28.57 
 
 		 266 aa  92.8  6e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  29.2 
 
 		 372 aa  92  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01800  conserved hypothetical protein  31.31 
 
 		 480 aa  88.2  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00595341  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  25.55 
 
 		 261 aa  85.5  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  26.07 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  26.75 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  26.98 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  30.14 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  27.82 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  32.26 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  26.67 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  26.78 
 
 		 242 aa  67  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  32.42 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3434  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1316  phosphonate metabolism protein PhnP  29.91 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2686  phosphonate metabolism protein PhnP  27.56 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.98 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2878  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.68 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  25.94 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0734  beta-lactamase domain protein  26.57 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1173  beta-lactamase domain protein  28.81 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.47 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.47 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>