229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1316 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1316  phosphonate metabolism protein PhnP  100 
 
 
249 aa  509  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2686  phosphonate metabolism protein PhnP  85.14 
 
 
249 aa  419  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  57.2 
 
 
260 aa  290  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  52.61 
 
 
250 aa  276  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  52.61 
 
 
250 aa  275  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  52.21 
 
 
250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5605  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  53.41 
 
 
252 aa  266  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4558  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  54.81 
 
 
252 aa  265  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3934  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  54.39 
 
 
252 aa  264  8e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03964  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  54.81 
 
 
252 aa  262  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3899  phosphonate metabolism protein PhnP  54.81 
 
 
252 aa  262  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03924  hypothetical protein  54.81 
 
 
252 aa  262  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4333  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  54.81 
 
 
252 aa  260  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4646  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  54.39 
 
 
252 aa  259  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2567  phosphonate metabolism protein, PhnP  54.07 
 
 
249 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0979832  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0583  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50.83 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0487  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50.42 
 
 
265 aa  248  5e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0296  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50.41 
 
 
252 aa  246  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2288  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50 
 
 
255 aa  241  7.999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.52798  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2259  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  52.85 
 
 
250 aa  238  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.373165  normal  0.710906 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  46.03 
 
 
251 aa  231  7.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2878  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.4 
 
 
254 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.78 
 
 
258 aa  230  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20450  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.4 
 
 
256 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.214049  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  48.02 
 
 
260 aa  228  6e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  48.02 
 
 
260 aa  228  6e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.4 
 
 
256 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  45.63 
 
 
251 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  47.2 
 
 
261 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  47.2 
 
 
261 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2090  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  42.28 
 
 
255 aa  221  8e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3684  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  41.5 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1173  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
246 aa  136  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 
261 aa  103  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  30.89 
 
 
252 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 
252 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  29.62 
 
 
260 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  27.37 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  29.89 
 
 
251 aa  99  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  28.79 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  30.04 
 
 
264 aa  94  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 
251 aa  92.8  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  28.85 
 
 
286 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  32.33 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  26.87 
 
 
239 aa  89.4  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  26.14 
 
 
253 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  29.92 
 
 
259 aa  86.7  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  29.12 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  29.66 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  27.92 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  23.95 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  25.58 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 
255 aa  79  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  28.36 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  28.88 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  26.09 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  25.29 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  28.09 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  28.96 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  25 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  26.26 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  22.85 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  25.94 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  25.41 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  25.88 
 
 
240 aa  68.6  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  29.53 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  30.68 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  25.32 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  27.21 
 
 
267 aa  67  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  23.37 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  29.72 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  25.42 
 
 
253 aa  64.7  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  27.08 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  28.46 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  20.94 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  26.94 
 
 
268 aa  62  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  28.03 
 
 
272 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  27.11 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  29.26 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  28.9 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 
243 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  21.09 
 
 
263 aa  60.8  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  23.36 
 
 
254 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  28.9 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  23.75 
 
 
372 aa  60.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  28.64 
 
 
243 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  29.68 
 
 
243 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  28.64 
 
 
243 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  29.52 
 
 
267 aa  59.7  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  25.09 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  24.54 
 
 
254 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1663  beta-lactamase-like protein  28.08 
 
 
274 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.703342  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  26.91 
 
 
492 aa  56.6  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  31.51 
 
 
251 aa  56.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>