134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3899 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03964  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  100 
 
 		 252 aa  522  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3899  phosphonate metabolism protein PhnP  100 
 
 		 252 aa  522  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03924  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  522  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5605  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  96.83 
 
 		 252 aa  509  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4558  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  97.62 
 
 		 252 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4333  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  97.22 
 
 		 252 aa  485  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4646  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  96.83 
 
 		 252 aa  485  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3934  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  96.43 
 
 		 252 aa  485  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0296  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  76.92 
 
 		 252 aa  406  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  56.68 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50.4 
 
 		 250 aa  270  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50 
 
 		 250 aa  269  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50 
 
 		 250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2686  phosphonate metabolism protein PhnP  54.25 
 
 		 249 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0583  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50.41 
 
 		 257 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2288  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.8 
 
 		 255 aa  256  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.52798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0487  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50.84 
 
 		 265 aa  256  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  48.41 
 
 		 251 aa  254  8e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  48.81 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1316  phosphonate metabolism protein PhnP  54.22 
 
 		 249 aa  249  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3684  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  45.2 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2090  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  44.49 
 
 		 255 aa  237  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2567  phosphonate metabolism protein, PhnP  49 
 
 		 249 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0979832  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  47.81 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  47.81 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  48.92 
 
 		 258 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  48.63 
 
 		 256 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2259  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.373165  normal  0.710906 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  47.22 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  47.22 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20450  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  47.84 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.214049  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2878  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  46.83 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1173  beta-lactamase domain protein  32.72 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  30.6 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  27.99 
 
 		 252 aa  93.2  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  29.41 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  27.76 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  25.65 
 
 		 260 aa  89  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  27.97 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  28.2 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  29.66 
 
 		 251 aa  85.5  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  25.98 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  29.66 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  27.31 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  27.38 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  25.67 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  26.12 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  29.89 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  28.41 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  23.77 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  27.47 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  26.72 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  32.22 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  27 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  24.28 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  31.35 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  28 
 
 		 267 aa  68.6  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  25.19 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  25.72 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  28.1 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  23.7 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  24.24 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  22.85 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  23.79 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  23.1 
 
 		 263 aa  62  0.000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  26.81 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  24.64 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  21.17 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  25.71 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  31.55 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  24.59 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  28 
 
 		 150 aa  57.8  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  30.81 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  24.65 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  25.09 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  27.47 
 
 		 492 aa  55.8  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  25.8 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  25.27 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  23.88 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  22.26 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  23.34 
 
 		 272 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  24.44 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  23.34 
 
 		 272 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  34.44 
 
 		 100 aa  52.8  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  25.7 
 
 		 266 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  23.72 
 
 		 272 aa  52.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  23.37 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  25.55 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  25.55 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  24.2 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3434  beta-lactamase domain protein  24.54 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  25.17 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  30.99 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>