220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1107 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 
252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  47.62 
 
 
255 aa  236  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  44.84 
 
 
252 aa  236  3e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  46.83 
 
 
251 aa  236  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  50 
 
 
270 aa  235  6e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  44.44 
 
 
253 aa  235  6e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  43.55 
 
 
252 aa  233  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  44.44 
 
 
264 aa  226  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  47.22 
 
 
253 aa  222  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  44.44 
 
 
286 aa  217  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  42.58 
 
 
261 aa  217  2e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 
252 aa  215  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  45.24 
 
 
251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  41.83 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  45.63 
 
 
251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  42.23 
 
 
255 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  46.03 
 
 
251 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  44.84 
 
 
257 aa  207  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  43.25 
 
 
254 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  41.34 
 
 
255 aa  204  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  42.97 
 
 
272 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  40.55 
 
 
254 aa  204  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  41.86 
 
 
265 aa  203  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  41.34 
 
 
254 aa  202  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  42.63 
 
 
254 aa  201  9e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  41.57 
 
 
253 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  44.66 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  40.55 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  41.86 
 
 
265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  43.48 
 
 
253 aa  196  3e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  37.4 
 
 
253 aa  195  7e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  41.06 
 
 
272 aa  194  8.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  43.08 
 
 
265 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  42.31 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  42.31 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  40.68 
 
 
272 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  40 
 
 
266 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  38.55 
 
 
265 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  38.55 
 
 
267 aa  184  8e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  38.74 
 
 
253 aa  184  9e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  43.02 
 
 
268 aa  184  9e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  42.47 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  41.6 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  39.02 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  38.4 
 
 
272 aa  182  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  38.4 
 
 
272 aa  182  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  38.61 
 
 
284 aa  182  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  37.79 
 
 
274 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  38.93 
 
 
270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  38.55 
 
 
266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  37.64 
 
 
274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  38.17 
 
 
267 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  38.66 
 
 
272 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  37.79 
 
 
267 aa  176  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  38.78 
 
 
263 aa  176  4e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  39.16 
 
 
264 aa  175  8e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  36.15 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  40.23 
 
 
254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  36.26 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  39.23 
 
 
268 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  40.23 
 
 
267 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  40.15 
 
 
266 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  38.29 
 
 
284 aa  167  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  39.47 
 
 
268 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  39.3 
 
 
262 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  38.26 
 
 
272 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  38.26 
 
 
272 aa  164  9e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  36.72 
 
 
492 aa  163  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  38.58 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  39.08 
 
 
259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  39.69 
 
 
269 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  33.71 
 
 
264 aa  156  3e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  36.61 
 
 
255 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  35.17 
 
 
266 aa  133  3e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  55.56 
 
 
100 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  33.6 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  43.66 
 
 
150 aa  106  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  30.13 
 
 
240 aa  105  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  32.49 
 
 
245 aa  105  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  30.47 
 
 
248 aa  104  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  29.14 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  30.74 
 
 
246 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.3 
 
 
260 aa  96.7  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1316  phosphonate metabolism protein PhnP  29.73 
 
 
249 aa  92.8  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2686  phosphonate metabolism protein PhnP  29.66 
 
 
249 aa  92  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.8 
 
 
250 aa  92  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.8 
 
 
250 aa  91.7  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.6 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.6 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  31.71 
 
 
239 aa  89.7  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  34.24 
 
 
240 aa  89.4  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  32.72 
 
 
256 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  32.33 
 
 
242 aa  87.8  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.66 
 
 
250 aa  87  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  32.23 
 
 
267 aa  86.7  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.2 
 
 
260 aa  87  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.2 
 
 
260 aa  87  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2878  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  32.1 
 
 
254 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>