178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3413 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
255 aa  523  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  65.87 
 
 
253 aa  348  5e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  61.35 
 
 
264 aa  328  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  59.76 
 
 
251 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  63.75 
 
 
251 aa  322  5e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  61.75 
 
 
251 aa  315  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  61.35 
 
 
251 aa  315  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  54.76 
 
 
286 aa  279  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  43.87 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  47.62 
 
 
252 aa  236  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  47.62 
 
 
252 aa  236  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  45.95 
 
 
270 aa  236  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  41.2 
 
 
252 aa  226  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  43.53 
 
 
260 aa  222  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  41.27 
 
 
252 aa  218  7.999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  42.06 
 
 
257 aa  209  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  40.7 
 
 
261 aa  209  3e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  40.32 
 
 
255 aa  208  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  41.41 
 
 
265 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  41.96 
 
 
255 aa  205  5e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  38.58 
 
 
253 aa  203  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  37.01 
 
 
254 aa  203  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  40.48 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  41.54 
 
 
265 aa  198  7e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  40.67 
 
 
272 aa  198  9e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  39.62 
 
 
271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  38.19 
 
 
253 aa  195  6e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  39.62 
 
 
267 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  41.54 
 
 
265 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  38.85 
 
 
272 aa  192  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  39.92 
 
 
270 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  40.84 
 
 
265 aa  191  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  42.08 
 
 
267 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  41.7 
 
 
266 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  41.35 
 
 
268 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  37.7 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  38.7 
 
 
265 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  40.3 
 
 
267 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  40.68 
 
 
284 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  37.4 
 
 
254 aa  186  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  37.3 
 
 
253 aa  185  5e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  36.61 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  41.38 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  42.52 
 
 
492 aa  182  3e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  36.5 
 
 
272 aa  181  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  36.7 
 
 
274 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  38.85 
 
 
265 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  38.85 
 
 
265 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  39.03 
 
 
272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  35.94 
 
 
254 aa  179  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  37.45 
 
 
267 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  36.33 
 
 
274 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  39.31 
 
 
266 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  36.5 
 
 
272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  36.5 
 
 
272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  42.23 
 
 
269 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  37.94 
 
 
253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  40.23 
 
 
265 aa  170  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  41.76 
 
 
269 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  39 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  38.7 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  38.67 
 
 
268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  39 
 
 
272 aa  166  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  36.92 
 
 
259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  36.82 
 
 
268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  36.08 
 
 
254 aa  163  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  35.23 
 
 
267 aa  159  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  33.7 
 
 
284 aa  160  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  38.37 
 
 
267 aa  156  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  36.6 
 
 
266 aa  155  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  35.41 
 
 
255 aa  152  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  34.75 
 
 
262 aa  152  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  35.23 
 
 
264 aa  149  4e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  32.71 
 
 
263 aa  144  1e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  31.82 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  33.97 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  54.55 
 
 
100 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  32.77 
 
 
240 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  30.71 
 
 
261 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  30.54 
 
 
239 aa  102  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  37.67 
 
 
150 aa  102  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  30.38 
 
 
270 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  28.57 
 
 
248 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 
245 aa  100  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  34.76 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  30.47 
 
 
246 aa  94  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.77 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.21 
 
 
260 aa  88.6  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.21 
 
 
260 aa  88.6  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  29.22 
 
 
242 aa  87.8  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  31.54 
 
 
239 aa  87  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.28 
 
 
250 aa  86.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.28 
 
 
250 aa  86.7  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.52 
 
 
250 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.88 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.07 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2686  phosphonate metabolism protein PhnP  30.08 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2567  phosphonate metabolism protein, PhnP  30.34 
 
 
249 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0979832  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.25 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5605  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.53 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>