181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1937 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  100 
 
 		 255 aa  524  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  53.75 
 
 		 254 aa  278  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  48.83 
 
 		 254 aa  249  4e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  42.41 
 
 		 265 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  41.15 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  41.15 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  43.66 
 
 		 269 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  41.6 
 
 		 265 aa  192  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  41.33 
 
 		 268 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  40.45 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  42.86 
 
 		 267 aa  185  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  40.36 
 
 		 272 aa  185  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  40.36 
 
 		 272 aa  184  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  40.46 
 
 		 265 aa  184  9e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  39.18 
 
 		 268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  42.37 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  41.42 
 
 		 267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  40.6 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  36.96 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  37.45 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  39.77 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  38.01 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  39.15 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  40.74 
 
 		 272 aa  172  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  37.08 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  39.06 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  38.2 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  36.43 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  38.2 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  40.07 
 
 		 265 aa  169  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  37.45 
 
 		 272 aa  168  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  37.74 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  35.58 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  40.37 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  37.59 
 
 		 274 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  40.47 
 
 		 251 aa  162  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  38.49 
 
 		 284 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  39.53 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  35.34 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  37.45 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  34.59 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  33.07 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  35.91 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  34.21 
 
 		 270 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  38.91 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  34.96 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  35.41 
 
 		 255 aa  152  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  36.61 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  36.61 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  35.34 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  35.19 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  36.29 
 
 		 286 aa  149  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  37.79 
 
 		 252 aa  148  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  34.72 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  34.08 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  34.1 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  35.27 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  36.92 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  35.41 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  29.89 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  33.08 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  36.96 
 
 		 251 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  33.58 
 
 		 270 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  31.91 
 
 		 253 aa  132  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  30.86 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  30.62 
 
 		 253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  31.11 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  30.27 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  32.95 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  29.55 
 
 		 254 aa  122  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  30.65 
 
 		 492 aa  120  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  29.96 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  28.52 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  27.94 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  28.02 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  27.76 
 
 		 248 aa  92.4  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  29.61 
 
 		 246 aa  92  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  44.44 
 
 		 100 aa  90.1  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  28.87 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  31.61 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  26.47 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  31.62 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  31.12 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  27.55 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  22.39 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  25.44 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.1 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  26.3 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2878  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.59 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2567  phosphonate metabolism protein, PhnP  28.68 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0979832  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  26.04 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.1 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2259  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.3 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.373165  normal  0.710906 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.78 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20450  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.37 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.214049  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.78 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.1 
 
 		 256 aa  62  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1316  phosphonate metabolism protein PhnP  25.19 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121557  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3434  beta-lactamase domain protein  28.31 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>