121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1800 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
274 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  94.16 
 
 
274 aa  540  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  70.79 
 
 
272 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  66.91 
 
 
284 aa  391  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  64.04 
 
 
272 aa  357  8e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  61.07 
 
 
272 aa  332  5e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  58.87 
 
 
272 aa  325  4.0000000000000003e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  58.87 
 
 
272 aa  325  4.0000000000000003e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  54.51 
 
 
271 aa  308  8e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  50 
 
 
265 aa  276  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  52.45 
 
 
265 aa  276  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  51.52 
 
 
265 aa  276  4e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  50 
 
 
267 aa  271  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  49.81 
 
 
266 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  48.67 
 
 
267 aa  263  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  50.78 
 
 
265 aa  263  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  49.04 
 
 
265 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  47.89 
 
 
267 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  46.62 
 
 
265 aa  257  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  46.62 
 
 
265 aa  257  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  50.94 
 
 
268 aa  256  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  47.13 
 
 
266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  47.69 
 
 
270 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  44.74 
 
 
265 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  47.01 
 
 
269 aa  247  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  48.87 
 
 
266 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  49.62 
 
 
269 aa  243  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  46.84 
 
 
268 aa  240  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  46.97 
 
 
268 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  47.76 
 
 
272 aa  240  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  47.76 
 
 
272 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  47.73 
 
 
267 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  45.19 
 
 
272 aa  235  8e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  43.07 
 
 
284 aa  231  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  46.59 
 
 
269 aa  226  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  38.61 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  38.35 
 
 
254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  40.47 
 
 
255 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  37.64 
 
 
252 aa  179  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  37.64 
 
 
252 aa  179  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  36.33 
 
 
267 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  36.33 
 
 
255 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  38.58 
 
 
254 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  34.96 
 
 
262 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  34.08 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  32.58 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  35.11 
 
 
251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  35.45 
 
 
264 aa  163  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  37.59 
 
 
255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  33.58 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  35.5 
 
 
251 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  34.34 
 
 
270 aa  159  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  32.96 
 
 
261 aa  159  5e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  34.5 
 
 
252 aa  159  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  34.73 
 
 
251 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  35.74 
 
 
251 aa  155  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  34.24 
 
 
254 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  38.55 
 
 
267 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  34.22 
 
 
253 aa  154  1e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  34.07 
 
 
260 aa  149  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  32.2 
 
 
253 aa  149  6e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 
253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  32.7 
 
 
253 aa  145  5e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
252 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  31.42 
 
 
254 aa  143  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  29.5 
 
 
252 aa  136  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  29.89 
 
 
264 aa  133  3e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  32.09 
 
 
263 aa  133  3e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 
257 aa  133  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  30.8 
 
 
492 aa  133  3.9999999999999996e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  32.85 
 
 
264 aa  132  5e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  29.23 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  29.43 
 
 
259 aa  104  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  45.63 
 
 
100 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  29.28 
 
 
266 aa  98.6  1e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  24.28 
 
 
248 aa  86.3  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  32.52 
 
 
267 aa  82  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  29.39 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  27.64 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  25.79 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01800  conserved hypothetical protein  25.62 
 
 
480 aa  75.9  0.0000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00595341  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  27.62 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  26.12 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  28.95 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  33.33 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  23.53 
 
 
239 aa  59.3  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.74 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  25.24 
 
 
239 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3434  beta-lactamase domain protein  24.16 
 
 
274 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1173  beta-lactamase domain protein  28.97 
 
 
246 aa  53.5  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3684  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.26 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2288  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  24.36 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.52798  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2213  beta-lactamase domain protein  26.6 
 
 
292 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.104031  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1269  beta-lactamase domain-containing protein  23.49 
 
 
252 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.914297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1239  beta-lactamase domain protein  23.49 
 
 
252 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.668505  normal  0.852311 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0583  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  24.25 
 
 
257 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>