150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0583 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0583  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  100 
 
 
257 aa  527  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0487  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  90.8 
 
 
265 aa  475  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  57.72 
 
 
250 aa  291  6e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  57.32 
 
 
250 aa  290  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  56.5 
 
 
250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  58.33 
 
 
260 aa  282  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5605  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.59 
 
 
252 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03964  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.58 
 
 
252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3899  phosphonate metabolism protein PhnP  49.58 
 
 
252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03924  hypothetical protein  49.58 
 
 
252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0296  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  51.22 
 
 
252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4558  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.58 
 
 
252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4333  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.17 
 
 
252 aa  249  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3934  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.17 
 
 
252 aa  249  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4646  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  48.75 
 
 
252 aa  249  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2090  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  48.37 
 
 
255 aa  246  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  48.79 
 
 
260 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  48.79 
 
 
260 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2686  phosphonate metabolism protein PhnP  50.41 
 
 
249 aa  240  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1316  phosphonate metabolism protein PhnP  50.83 
 
 
249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3684  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  47.58 
 
 
255 aa  236  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50.2 
 
 
256 aa  234  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20450  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.8 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.214049  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2288  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.59 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.52798  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2567  phosphonate metabolism protein, PhnP  49.8 
 
 
249 aa  231  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0979832  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50.81 
 
 
261 aa  225  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50.81 
 
 
261 aa  225  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  47.52 
 
 
258 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  46.09 
 
 
251 aa  218  7.999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  45.68 
 
 
251 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2878  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  47.37 
 
 
254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2259  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.17 
 
 
250 aa  215  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.373165  normal  0.710906 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1173  beta-lactamase domain protein  33.49 
 
 
246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  28.2 
 
 
254 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  30.27 
 
 
253 aa  102  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 
270 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 
253 aa  97.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  31.64 
 
 
255 aa  96.7  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 
253 aa  95.9  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  30.2 
 
 
239 aa  92.8  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  31.94 
 
 
264 aa  92  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  28.06 
 
 
270 aa  91.3  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  30.94 
 
 
286 aa  89.7  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  27.99 
 
 
253 aa  87.8  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  28.04 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  29.85 
 
 
261 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  28.95 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  25.67 
 
 
253 aa  84  0.000000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  28.41 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  25.29 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  28.73 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  28.19 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  27.97 
 
 
251 aa  79  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  28.36 
 
 
267 aa  79  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  30.3 
 
 
251 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 
251 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  25.67 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  29.77 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  23.75 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  28.57 
 
 
492 aa  72  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  27.82 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  27.82 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  27.76 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  27.03 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  27.04 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  27.06 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  24.56 
 
 
246 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
239 aa  62  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  26.37 
 
 
265 aa  62  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  26.84 
 
 
265 aa  60.5  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  25.78 
 
 
240 aa  59.7  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  23.02 
 
 
264 aa  59.3  0.00000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  33.86 
 
 
150 aa  57.4  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  24.56 
 
 
245 aa  57  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  21.93 
 
 
263 aa  56.6  0.0000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  25.96 
 
 
247 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  27.66 
 
 
244 aa  56.2  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  21.93 
 
 
264 aa  55.8  0.0000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  26.67 
 
 
372 aa  55.5  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  25.84 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  26.72 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  28.04 
 
 
268 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  26.69 
 
 
265 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  25.56 
 
 
248 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  26.69 
 
 
265 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  26.75 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  25.91 
 
 
244 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
265 aa  52  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  27.95 
 
 
244 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  25.45 
 
 
272 aa  50.4  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  25.45 
 
 
272 aa  50.4  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  25.85 
 
 
284 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  27.93 
 
 
244 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3434  beta-lactamase domain protein  23.75 
 
 
274 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  26.67 
 
 
266 aa  49.3  0.00007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>