More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0789 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  100 
 
 		 244 aa  497  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  89.75 
 
 		 244 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  86.89 
 
 		 244 aa  447  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  80.74 
 
 		 244 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0796  hypothetical protein  66.39 
 
 		 244 aa  324  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030667 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  53.28 
 
 		 243 aa  255  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  51.97 
 
 		 243 aa  248  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  48.8 
 
 		 247 aa  231  6e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  47.56 
 
 		 243 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  47.56 
 
 		 243 aa  224  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  42.74 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  39.11 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  32.19 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  31.76 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  29 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  28.05 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  30.53 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  26.67 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  25.46 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  26.01 
 
 		 306 aa  75.5  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  31.17 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  29.1 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  28.95 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  27.75 
 
 		 268 aa  72  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  30.57 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  27.63 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  33.16 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  29.1 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  29.87 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  30.65 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  25.6 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  25.99 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  28.8 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  28.8 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  25.25 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  27.63 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  26.38 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  27.62 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  27.9 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  32.82 
 
 		 304 aa  67  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  23.65 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  26.34 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  26.29 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1656  beta-lactamase domain-containing protein  25.66 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  25.2 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  29.07 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  28.22 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  26.26 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  24.5 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  27.71 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  24.39 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  27.14 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  26.99 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  25.2 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  30.17 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  23.08 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  24.46 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2459  beta-lactamase domain-containing protein  25.28 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  26.75 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  29.51 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  24.54 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  29.66 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08360  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  28.24 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  24.4 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  27.31 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  25.33 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  25.33 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  25.33 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  25.33 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  25.33 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  23.75 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  27.75 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  24.1 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  24.1 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3172  beta-lactamase superfamily hydrolase  28.57 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  29.17 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  28.97 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  27.31 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0782  ribonuclease Z  35.11 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  35.11 
 
 		 313 aa  62  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  23.72 
 
 		 310 aa  62  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  24.1 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  24.26 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  23.69 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  24.26 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  24.26 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  29.57 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  26.17 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  36.67 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  25.21 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  32.8 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3244  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.36 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  24.26 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0563  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  24.31 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>