More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1910 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 248 aa  498  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  39.53 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  39.92 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  37.44 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  32.03 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  23.41 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  23.51 
 
 		 305 aa  89.7  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 235 aa  89.4  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  26.36 
 
 		 250 aa  87  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  22.34 
 
 		 314 aa  86.3  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  29.55 
 
 		 326 aa  85.9  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  28.51 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  29.57 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  31.49 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  26.47 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  26.12 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  25.09 
 
 		 309 aa  82  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  22.43 
 
 		 310 aa  82  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  26.83 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.9 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  22.58 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  24.65 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  30.12 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  25.16 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  25.16 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  26.32 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  25.16 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  25.99 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  26.54 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  25.16 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  25.16 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  25.16 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  25.16 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.23 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  22.06 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  25.08 
 
 		 309 aa  78.6  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  25.16 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  22.97 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  24.03 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  24.28 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.86 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1678  beta-lactamase domain-containing protein  26.04 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.554215  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  27.42 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  22.1 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  24.52 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  33.15 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  26.42 
 
 		 319 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  27.34 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  27.4 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  27.92 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  28.78 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  30.18 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  29.79 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  26.14 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  28.29 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.79 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  26.27 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  27.93 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  26.45 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  21.61 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  29.33 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  25.96 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  27.42 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  30.42 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  30.53 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  27 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  26.98 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  27.16 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  29.96 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  27.48 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  28.16 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  25.36 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.99 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  26.03 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  24.82 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  24.43 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  24.43 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  24.43 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  24.43 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  24.43 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  28 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  24.76 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  23.95 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  23.95 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  22.04 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  24.1 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  24.65 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  24.05 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  29.46 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  26.22 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>