258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2299 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 337 aa  671    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  39.63 
 
 		 320 aa  225  8e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  38.53 
 
 		 319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  38.26 
 
 		 321 aa  215  9e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5998  metal-dependent hydrolase  35.75 
 
 		 414 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  36.52 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  32.12 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  34.36 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  34.36 
 
 		 312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  34.36 
 
 		 312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  34.36 
 
 		 312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  34.36 
 
 		 312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0205  hypothetical protein  34.09 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3785  putative tRNA 3' processing RNase Z-like protein  34.54 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  31.55 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  30.87 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  31.4 
 
 		 288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1722  beta-lactamase domain-containing protein  34.67 
 
 		 324 aa  122  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261159  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  27.73 
 
 		 328 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17980  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  29.2 
 
 		 331 aa  119  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182434  normal  0.52881 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  28.66 
 
 		 312 aa  119  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0182  beta-lactamase-like protein  30.73 
 
 		 381 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.530565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  30.31 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  31.02 
 
 		 280 aa  116  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  29.43 
 
 		 381 aa  116  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  30 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13830  hypothetical protein  28.74 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.491323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  32 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  32 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  27.94 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  32 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  28.05 
 
 		 286 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  28.15 
 
 		 280 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  29.39 
 
 		 323 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  33.66 
 
 		 248 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  27.87 
 
 		 322 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  29.43 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  27.71 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  29.14 
 
 		 318 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  26.13 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  29.91 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  27.6 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.48 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.43 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  25.53 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  32.32 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  35.08 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  25.08 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  27.07 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  24.17 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  29.81 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  28.97 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  29.12 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  26.36 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  26.62 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  26.28 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2169  ribonuclease Z  25 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  25.07 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  26.45 
 
 		 395 aa  72.8  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  23.2 
 
 		 314 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.2 
 
 		 314 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  23.81 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  31.1 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  29.58 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  30.94 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  33.8 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  24.92 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  25.63 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.6 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  27.3 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  24.01 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  25.33 
 
 		 235 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  26.42 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.44 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2459  beta-lactamase domain-containing protein  24.75 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  22.8 
 
 		 315 aa  67  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  27.43 
 
 		 251 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  24.59 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  25.41 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  26.05 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0540  Ribonuclease Z  28.21 
 
 		 307 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  25.63 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  24.47 
 
 		 235 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 243 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  25 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  23.49 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  24.54 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  28.09 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  26.39 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  25.17 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12268  predicted protein  24.14 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812865  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  26.21 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  24.83 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  28.93 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>