261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0210 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  100 
 
 		 314 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  44.03 
 
 		 320 aa  278  8e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  45.33 
 
 		 321 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  44.83 
 
 		 319 aa  276  4e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  46.43 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  44.73 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  44.41 
 
 		 312 aa  242  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  44.41 
 
 		 312 aa  242  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  44.41 
 
 		 312 aa  242  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  44.41 
 
 		 312 aa  242  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  44.09 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  42.7 
 
 		 288 aa  224  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  33.03 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5998  metal-dependent hydrolase  33.24 
 
 		 414 aa  158  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3785  putative tRNA 3' processing RNase Z-like protein  31.29 
 
 		 393 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  32.48 
 
 		 337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17980  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  33.02 
 
 		 331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182434  normal  0.52881 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  29.97 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  30.18 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0205  hypothetical protein  30.27 
 
 		 395 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0182  beta-lactamase-like protein  28.68 
 
 		 381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.530565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  29.55 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  28.62 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  29.12 
 
 		 322 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  29.25 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  27.68 
 
 		 280 aa  106  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13830  hypothetical protein  29.61 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.491323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  25.89 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  25.26 
 
 		 286 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  26.79 
 
 		 381 aa  94  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  31.5 
 
 		 280 aa  93.6  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1722  beta-lactamase domain-containing protein  32.17 
 
 		 324 aa  93.2  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261159  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  27.02 
 
 		 251 aa  90.5  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  27.17 
 
 		 244 aa  88.6  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  26.77 
 
 		 319 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  27.02 
 
 		 285 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  27.02 
 
 		 285 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  27.02 
 
 		 285 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  26.77 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  27.68 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  24.48 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  25.74 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  24.42 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  26.38 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  24.73 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  26.46 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2229  ribonuclease Z  24.92 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1128  beta-lactamase domain-containing protein  25.42 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.39773 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2459  beta-lactamase domain-containing protein  25.14 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  25.89 
 
 		 256 aa  72.4  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  23.05 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  23.9 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  23.93 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  23.93 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  23.95 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  26.76 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  23.44 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  23.02 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  24.11 
 
 		 244 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  24.01 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  22.69 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2269  beta-lactamase domain protein  27.18 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  26.79 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  25.09 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  26.16 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  24.37 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  23.69 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  23.63 
 
 		 395 aa  65.9  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  25.91 
 
 		 244 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  25.09 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  25.62 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  25.09 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  25.09 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  27.96 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  28.18 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  25.09 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  25.09 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  27.11 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  23.76 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  25.44 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  23.42 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  22.07 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  24.73 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  24.74 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  24.74 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  24.38 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  24.81 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  22.91 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  24.92 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  23.05 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  24.29 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.38 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>