298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1104 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 249 aa  511  1e-144  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0186  beta-lactamase domain-containing protein  31.17 
 
 		 228 aa  102  7e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000106094  normal  0.0583426 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  27.87 
 
 		 306 aa  89  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  24.17 
 
 		 305 aa  85.9  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  31.73 
 
 		 288 aa  85.5  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  25.63 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  24.83 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  24.83 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  24.83 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  24.83 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  24.83 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  24.83 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  24.83 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  24.48 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  32.26 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  26.28 
 
 		 303 aa  78.6  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  24.14 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  25.78 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  25.1 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  24.28 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  24.83 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  24.48 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  24.92 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0988  beta-lactamase domain protein  27.72 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  21.81 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  31.16 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  24.83 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  23.88 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  24.82 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  23.85 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  25.27 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  29.55 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  24.54 
 
 		 308 aa  72  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  25 
 
 		 318 aa  72  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  26.64 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  27.24 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  26.91 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  26.91 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  24.37 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1716  ribonuclease Z  22.1 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  26.61 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  31.94 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  22.86 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  28.8 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  30.7 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1071  beta-lactamase superfamily hydrolase  23.61 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  25.53 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  24.3 
 
 		 319 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  28.97 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  24.3 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  23.1 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  24.68 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  29.51 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  23.67 
 
 		 318 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  23.77 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  23.77 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2672  beta-lactamase domain protein  24.35 
 
 		 320 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.162319 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  27.56 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  27.56 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  23.77 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  23.77 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  27.02 
 
 		 314 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  27.56 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  23.94 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  29.69 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  23.55 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1656  beta-lactamase domain-containing protein  25.89 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  23.77 
 
 		 341 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  25.26 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  24.91 
 
 		 319 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  27.63 
 
 		 300 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  23.86 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  24.2 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  23.1 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  30.53 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  26.15 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  23.1 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  22.9 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  27.15 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  23.66 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  26.61 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  23.66 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  23.66 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  23.66 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  23.66 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  23.1 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  23.66 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  28.7 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  23.57 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  22.85 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  27.2 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.57 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  23.66 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1383  ribonuclease Z  28.19 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.409103  normal  0.0217204 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  31.55 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>