299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12435 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  100 
 
 		 280 aa  558  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  77.7 
 
 		 300 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  76.62 
 
 		 286 aa  411  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  74.1 
 
 		 285 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  74.1 
 
 		 285 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  74.1 
 
 		 285 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  36.18 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  36.97 
 
 		 322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  36.62 
 
 		 323 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  35.59 
 
 		 381 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  33.45 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  33.1 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  32.37 
 
 		 320 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  33.7 
 
 		 283 aa  135  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  29.54 
 
 		 312 aa  126  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  34.36 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  29.35 
 
 		 250 aa  122  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  28.06 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  30.42 
 
 		 288 aa  119  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  31.79 
 
 		 334 aa  118  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  31.37 
 
 		 323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5998  metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 		 414 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  26.98 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1722  beta-lactamase domain-containing protein  30.62 
 
 		 324 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261159  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  27.68 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0205  hypothetical protein  29.85 
 
 		 395 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  26.67 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  26.67 
 
 		 312 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  26.67 
 
 		 312 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  26.67 
 
 		 312 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  26.67 
 
 		 312 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17980  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  30.49 
 
 		 331 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182434  normal  0.52881 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  27.74 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  29.12 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3785  putative tRNA 3' processing RNase Z-like protein  29.5 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 337 aa  99.8  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  29.09 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  26.64 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13830  hypothetical protein  26.81 
 
 		 375 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.491323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0182  beta-lactamase-like protein  28.24 
 
 		 381 aa  92.8  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.530565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  29.2 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  32.47 
 
 		 251 aa  90.5  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  27.42 
 
 		 328 aa  90.1  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  27.59 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  26.88 
 
 		 305 aa  89.7  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 246 aa  89.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  27.59 
 
 		 318 aa  88.6  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  28.42 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  27.3 
 
 		 395 aa  87.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  26.18 
 
 		 244 aa  87  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  33.6 
 
 		 248 aa  86.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  27.24 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  29.59 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  29.2 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  25.81 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  25.23 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  26.18 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  25 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  25 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  30.36 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  29.52 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  22.85 
 
 		 393 aa  82.4  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  25.08 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  29.93 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  24.04 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  28 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.33 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  29.88 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  27.52 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  27.52 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  24.73 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  25.76 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  26.75 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1678  beta-lactamase domain-containing protein  25.32 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.554215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  32 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  32.66 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  29.67 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  29.6 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  21.99 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  29.3 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  31.88 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  27.16 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  24.29 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  29.56 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  26.83 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  23.45 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1441  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0828256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  25.17 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  25.62 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  24.56 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  25.17 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  25.62 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  25.62 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  25.62 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  25.62 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  31.74 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  24.83 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  27.93 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>