275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2670 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  100 
 
 		 364 aa  721    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  37.86 
 
 		 381 aa  212  7e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  36.18 
 
 		 280 aa  162  9e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  34.44 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  36.67 
 
 		 323 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  36 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  32.76 
 
 		 286 aa  143  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  34.6 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  34.6 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  34.6 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  32.52 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  32.87 
 
 		 319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  32.65 
 
 		 283 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  32.87 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  31.65 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  29.28 
 
 		 309 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  28.62 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  30.47 
 
 		 280 aa  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  28.24 
 
 		 312 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  28.24 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  28.24 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  28.24 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  31.48 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  28.24 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  30.82 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  30.99 
 
 		 334 aa  99.4  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17980  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  30.49 
 
 		 331 aa  97.8  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182434  normal  0.52881 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5998  metal-dependent hydrolase  29.89 
 
 		 414 aa  96.7  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0205  hypothetical protein  30.63 
 
 		 395 aa  96.7  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 		 337 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  26.95 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  26.86 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  29.97 
 
 		 288 aa  89  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13830  hypothetical protein  26.82 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.491323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1722  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261159  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  26.99 
 
 		 314 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2459  beta-lactamase domain-containing protein  26.71 
 
 		 421 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3785  putative tRNA 3' processing RNase Z-like protein  29.43 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  30.2 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  26.85 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0182  beta-lactamase-like protein  28.09 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.530565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  25.93 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  30.5 
 
 		 262 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  25.38 
 
 		 255 aa  68.9  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  29.26 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  24.35 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  25.84 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  26.8 
 
 		 326 aa  67  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  26.23 
 
 		 318 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  29.32 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  26.85 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  27.43 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  28.42 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  24.57 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  22.95 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  27.88 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  27.91 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  25.08 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  26.71 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  28.87 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  27.72 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 		 243 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  25.88 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 		 246 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  25.45 
 
 		 318 aa  62.8  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  26.14 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  25.67 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  25.67 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  26.96 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  25.67 
 
 		 311 aa  62  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  26.35 
 
 		 268 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  25.67 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  25.67 
 
 		 311 aa  62  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  28.86 
 
 		 255 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  26.47 
 
 		 308 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  25.67 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  25.67 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  25.67 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.08 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  23.17 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  26.92 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  27.14 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  25.43 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  25.38 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  26.17 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  26.48 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  25.29 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  26.22 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  25.87 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  25.87 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  25.87 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  25.87 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  25.87 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  25.87 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  22.99 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  25.87 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>