274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0417 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  100 
 
 		 326 aa  641    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  41.88 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  41.75 
 
 		 321 aa  229  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  41.18 
 
 		 393 aa  228  8e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  39.8 
 
 		 305 aa  228  9e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  40.32 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  42.77 
 
 		 307 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  40.52 
 
 		 315 aa  223  4.9999999999999996e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  40 
 
 		 311 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  39.81 
 
 		 305 aa  221  9e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  39.81 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  40 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  39.81 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  39.81 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  39.81 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  40.85 
 
 		 345 aa  219  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  39.81 
 
 		 305 aa  220  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.42 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.51 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  38.91 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  38.59 
 
 		 305 aa  212  7e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.21 
 
 		 312 aa  212  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  39.2 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  43.75 
 
 		 305 aa  211  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  39.2 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  37.09 
 
 		 312 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  42.86 
 
 		 304 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  39.48 
 
 		 341 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  39.48 
 
 		 341 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  40.75 
 
 		 320 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  39.48 
 
 		 305 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  39.48 
 
 		 305 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  39.48 
 
 		 305 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  39.53 
 
 		 307 aa  209  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  37.66 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  38.54 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  38.54 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  38.54 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  38.54 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  38.54 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  38.54 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  38.54 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  38.54 
 
 		 307 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.84 
 
 		 312 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  35.59 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  37.09 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.09 
 
 		 314 aa  202  8e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  41.4 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  42.07 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  37.86 
 
 		 314 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  40.71 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  37.86 
 
 		 314 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  42.47 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  44.29 
 
 		 314 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  38.08 
 
 		 319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  36.54 
 
 		 318 aa  192  6e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05331  beta-lactamase superfamily hydrolase  38.64 
 
 		 318 aa  192  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  36.75 
 
 		 313 aa  192  9e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  37.86 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  41.44 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  37.13 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  43.36 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  35.12 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  35.27 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  42.31 
 
 		 318 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  42.31 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  40.07 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  39.19 
 
 		 314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0738  ribonuclease Z  35.1 
 
 		 304 aa  182  8.000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  43.61 
 
 		 313 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  34.67 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  35.02 
 
 		 322 aa  180  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1716  ribonuclease Z  35.48 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  33.55 
 
 		 314 aa  175  8e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  34.88 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12268  predicted protein  37.2 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812865  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  34.11 
 
 		 307 aa  174  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  35.81 
 
 		 308 aa  172  7.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  33.89 
 
 		 309 aa  172  9e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  38.89 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  38.57 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  34.43 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  38.23 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  34.98 
 
 		 304 aa  169  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  32.85 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  32.33 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  32.08 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2672  beta-lactamase domain protein  37.2 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.162319 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  31.58 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  32.89 
 
 		 308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  41.08 
 
 		 312 aa  166  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1554  ribonuclease Z  39.72 
 
 		 317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  30.82 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  38.66 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  36.2 
 
 		 319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1592  ribonuclease Z  30.66 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359546  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1561  ribonuclease Z  30.66 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1071  beta-lactamase superfamily hydrolase  32.71 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2067  ribonuclease Z  37.25 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000376833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0914  ribonuclease Z  37.83 
 
 		 307 aa  149  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>