260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0914 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0914  ribonuclease Z  100 
 
 		 307 aa  617  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0857  ribonuclease Z  88.85 
 
 		 309 aa  555  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2269  beta-lactamase domain protein  66.45 
 
 		 306 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5799  ribonuclease Z  64.45 
 
 		 304 aa  386  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1128  beta-lactamase domain-containing protein  59.67 
 
 		 327 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.39773 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08200  ribonuclease Z  61.64 
 
 		 306 aa  350  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  56.17 
 
 		 316 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  56.03 
 
 		 318 aa  329  3e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2229  ribonuclease Z  55.92 
 
 		 324 aa  323  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1991  ribonuclease Z  56.07 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1441  beta-lactamase domain protein  51.97 
 
 		 330 aa  292  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0828256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2067  ribonuclease Z  54.28 
 
 		 298 aa  290  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000376833 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2340  ribonuclease Z  52.81 
 
 		 343 aa  265  5e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.103248  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0625  ribonuclease Z  42.62 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4220  Ribonuclease Z  48.4 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  33.77 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  31.79 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  28.95 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  37.83 
 
 		 326 aa  149  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  33.68 
 
 		 307 aa  149  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  32.46 
 
 		 307 aa  148  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  32.46 
 
 		 307 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  32.79 
 
 		 307 aa  148  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  32.79 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  32.79 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  35.05 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  34.69 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  32.79 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  32.79 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  32.79 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  32.79 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  34.6 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  34.6 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  34.91 
 
 		 305 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  34.91 
 
 		 305 aa  145  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  34.91 
 
 		 305 aa  145  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  34.91 
 
 		 305 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  34.97 
 
 		 307 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  34.73 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  33.55 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  34.91 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  31.17 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  32.13 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  33.55 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 315 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  32.69 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  32.12 
 
 		 306 aa  144  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  35.47 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  35.47 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  35.47 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  35.47 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  35.47 
 
 		 341 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  32.14 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.58 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  35.43 
 
 		 309 aa  139  7.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  38.91 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  34.08 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  33.97 
 
 		 393 aa  138  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  33.76 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  35.74 
 
 		 312 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  31.43 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  33.12 
 
 		 310 aa  132  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  30.69 
 
 		 314 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.87 
 
 		 327 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  31.65 
 
 		 309 aa  132  9e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  34.64 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  29.52 
 
 		 312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  33.12 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.13 
 
 		 312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.69 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  32.46 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12268  predicted protein  32.67 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812865  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  33.99 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  35.08 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  32.25 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.19 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  33.77 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  32.69 
 
 		 307 aa  126  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  33.85 
 
 		 319 aa  125  6e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  28.67 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1071  beta-lactamase superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  30.63 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  33.01 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  34.75 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1716  ribonuclease Z  30.23 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  35.08 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  34.29 
 
 		 319 aa  123  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  30.46 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.26 
 
 		 312 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05331  beta-lactamase superfamily hydrolase  36.16 
 
 		 318 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  28.24 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  34.31 
 
 		 313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 		 302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  33.65 
 
 		 319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  28.57 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  28.38 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  30 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  28.23 
 
 		 304 aa  116  5e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>