249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0857 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0857  ribonuclease Z  100 
 
 
309 aa  624  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0914  ribonuclease Z  88.85 
 
 
307 aa  555  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2269  beta-lactamase domain protein  65.47 
 
 
306 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5799  ribonuclease Z  62.83 
 
 
304 aa  381  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08200  ribonuclease Z  62.37 
 
 
306 aa  361  1e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444748  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  55.87 
 
 
316 aa  350  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1128  beta-lactamase domain-containing protein  58.63 
 
 
327 aa  343  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.39773 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  55.91 
 
 
318 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2229  ribonuclease Z  56.45 
 
 
324 aa  334  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1991  ribonuclease Z  56.68 
 
 
309 aa  317  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1441  beta-lactamase domain protein  51.8 
 
 
330 aa  292  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0828256  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2067  ribonuclease Z  54.79 
 
 
298 aa  287  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000376833 
 
 
-
 
NC_002620  TC0625  ribonuclease Z  43.19 
 
 
304 aa  267  2e-70  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2340  ribonuclease Z  52.32 
 
 
343 aa  261  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.103248  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4220  Ribonuclease Z  49.03 
 
 
314 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270718  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  33.11 
 
 
305 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  36.67 
 
 
341 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  36.67 
 
 
341 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  29.01 
 
 
308 aa  153  4e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  36.82 
 
 
305 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  36.82 
 
 
305 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  36.82 
 
 
305 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  36.52 
 
 
305 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  36.52 
 
 
311 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  35.46 
 
 
311 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  36.52 
 
 
305 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  36.52 
 
 
305 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  35.82 
 
 
305 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  36.52 
 
 
305 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  34.67 
 
 
307 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  35.46 
 
 
311 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  31 
 
 
305 aa  149  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  36.52 
 
 
305 aa  149  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  32.88 
 
 
307 aa  145  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  32.88 
 
 
307 aa  145  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  33.33 
 
 
315 aa  145  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  37.5 
 
 
326 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  34.29 
 
 
314 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  34.29 
 
 
314 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  32.3 
 
 
307 aa  145  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  32.3 
 
 
307 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  32.88 
 
 
307 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  32.88 
 
 
307 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  34.41 
 
 
318 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  32.88 
 
 
307 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  32.88 
 
 
307 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  32.88 
 
 
307 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  33.33 
 
 
308 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  32.99 
 
 
307 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.6 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  34.29 
 
 
345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12268  predicted protein  35.18 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812865  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  32.68 
 
 
307 aa  140  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  34.31 
 
 
307 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  30.79 
 
 
312 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  33.21 
 
 
309 aa  139  6e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  33.23 
 
 
321 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  34.52 
 
 
319 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  32.8 
 
 
393 aa  136  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  33.44 
 
 
306 aa  136  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.23 
 
 
312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  32.16 
 
 
314 aa  135  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  33.87 
 
 
319 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.39 
 
 
327 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  33.89 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.16 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  31.78 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  33.11 
 
 
309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  31.75 
 
 
309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.97 
 
 
312 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  32.77 
 
 
307 aa  129  7.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1071  beta-lactamase superfamily hydrolase  34.05 
 
 
325 aa  129  8.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  31.11 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  34.2 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  35.92 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  32.31 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  35.62 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  29.67 
 
 
299 aa  127  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  32.58 
 
 
321 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  31.02 
 
 
305 aa  125  9e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  28.39 
 
 
314 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  28.48 
 
 
310 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  35.61 
 
 
305 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  31.94 
 
 
319 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  30.67 
 
 
310 aa  123  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  32.62 
 
 
319 aa  123  4e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  33.22 
 
 
305 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  28.9 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  29.45 
 
 
301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  32.08 
 
 
314 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  32.3 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  32.89 
 
 
318 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  28.62 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  31.49 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05331  beta-lactamase superfamily hydrolase  34.47 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  27.91 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  31.45 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 
302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  29.83 
 
 
303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  32.89 
 
 
318 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>