More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2276 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  100 
 
 		 308 aa  624  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  77.45 
 
 		 307 aa  508  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  70.68 
 
 		 307 aa  461  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  70.68 
 
 		 307 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  70.68 
 
 		 307 aa  462  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  70.68 
 
 		 307 aa  463  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  70.68 
 
 		 307 aa  461  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  70.68 
 
 		 307 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  71.34 
 
 		 307 aa  463  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  70.68 
 
 		 307 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  70.68 
 
 		 307 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  70.68 
 
 		 307 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  69.38 
 
 		 307 aa  448  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  59.87 
 
 		 309 aa  384  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  56.73 
 
 		 318 aa  358  5e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  55.74 
 
 		 309 aa  342  5.999999999999999e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1071  beta-lactamase superfamily hydrolase  51.11 
 
 		 325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  52.3 
 
 		 304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  50.99 
 
 		 309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  49.67 
 
 		 309 aa  311  7.999999999999999e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  52.98 
 
 		 307 aa  308  8e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  50.97 
 
 		 313 aa  308  8e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  49.18 
 
 		 305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  49.18 
 
 		 305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  49.18 
 
 		 305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  49.18 
 
 		 305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  49.18 
 
 		 305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  49.18 
 
 		 311 aa  306  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  49.2 
 
 		 318 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  49.18 
 
 		 311 aa  306  3e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  49.18 
 
 		 305 aa  305  7e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  48.52 
 
 		 311 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  46.58 
 
 		 312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  45.81 
 
 		 393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  49.51 
 
 		 341 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  49.18 
 
 		 305 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  47.25 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  49.51 
 
 		 305 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  49.51 
 
 		 305 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  49.51 
 
 		 305 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  49.51 
 
 		 341 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  45.98 
 
 		 345 aa  295  6e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  47.25 
 
 		 314 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  47.25 
 
 		 314 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  45.28 
 
 		 312 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  46.3 
 
 		 315 aa  292  6e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  45.93 
 
 		 312 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  44.95 
 
 		 312 aa  289  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  48.22 
 
 		 320 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  46.45 
 
 		 306 aa  281  8.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1561  ribonuclease Z  45.48 
 
 		 306 aa  281  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.32 
 
 		 327 aa  280  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1592  ribonuclease Z  45.48 
 
 		 306 aa  281  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359546  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  44.94 
 
 		 319 aa  275  5e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.69 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  41.69 
 
 		 314 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  44.3 
 
 		 319 aa  270  2e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05331  beta-lactamase superfamily hydrolase  43.81 
 
 		 318 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  40.66 
 
 		 305 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  38.44 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12268  predicted protein  41.64 
 
 		 311 aa  216  4e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812865  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  38.91 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  43.37 
 
 		 319 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  40.13 
 
 		 321 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  42.6 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  40.71 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  38.31 
 
 		 307 aa  202  4e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  41.67 
 
 		 310 aa  202  5e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  41.52 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  42.91 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  37.77 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  41.49 
 
 		 314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  39.02 
 
 		 301 aa  195  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  35.62 
 
 		 314 aa  192  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  36.36 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  38.36 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  37.24 
 
 		 318 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  35.95 
 
 		 305 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  34.64 
 
 		 314 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  37.11 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  36.79 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  36.9 
 
 		 318 aa  185  9e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  34.74 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2169  ribonuclease Z  35.67 
 
 		 323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  35.79 
 
 		 308 aa  182  8.000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  35.18 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  34.77 
 
 		 302 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  37.21 
 
 		 301 aa  172  7.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  34.54 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  35.62 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  37.46 
 
 		 312 aa  169  8e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  35.06 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  35.53 
 
 		 313 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_002620  TC0625  ribonuclease Z  34.63 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  34.8 
 
 		 304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  34.31 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1808  ribonuclease Z  31.78 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0346445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0738  ribonuclease Z  35.5 
 
 		 304 aa  162  6e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  35.9 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  33.74 
 
 		 318 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>