More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5044 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  100 
 
 
320 aa  662    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  75.96 
 
 
345 aa  523  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  76.51 
 
 
315 aa  516  1.0000000000000001e-145  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  73.79 
 
 
318 aa  498  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  74.68 
 
 
314 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  74.68 
 
 
314 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  72.03 
 
 
321 aa  491  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  69.35 
 
 
393 aa  467  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  61.27 
 
 
319 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  57.19 
 
 
327 aa  391  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  60 
 
 
319 aa  383  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05331  beta-lactamase superfamily hydrolase  59.87 
 
 
318 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  52.08 
 
 
314 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  52.4 
 
 
314 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  50.48 
 
 
312 aa  359  4e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  50.8 
 
 
312 aa  355  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  50.16 
 
 
312 aa  354  1e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  49.2 
 
 
312 aa  349  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  47.74 
 
 
307 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  47.42 
 
 
307 aa  301  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  47.74 
 
 
307 aa  300  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  47.74 
 
 
307 aa  300  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  47.74 
 
 
307 aa  300  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  47.74 
 
 
307 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  47.74 
 
 
307 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  47.74 
 
 
307 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  47.74 
 
 
307 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  47.1 
 
 
307 aa  299  5e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  48.22 
 
 
308 aa  298  8e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  47.57 
 
 
307 aa  294  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  46.45 
 
 
307 aa  287  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  44.66 
 
 
309 aa  275  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  46.23 
 
 
305 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  44.41 
 
 
318 aa  265  5.999999999999999e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1071  beta-lactamase superfamily hydrolase  42.07 
 
 
325 aa  262  4.999999999999999e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  44.44 
 
 
305 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  44.44 
 
 
305 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  44.44 
 
 
305 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  44.44 
 
 
341 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  44.63 
 
 
304 aa  260  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  44.12 
 
 
341 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  42.21 
 
 
311 aa  257  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  43.55 
 
 
309 aa  257  2e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  42.21 
 
 
305 aa  256  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  42.21 
 
 
305 aa  256  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  42.21 
 
 
305 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  42.21 
 
 
305 aa  256  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  42.21 
 
 
305 aa  255  8e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  41.88 
 
 
305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  41.88 
 
 
311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  41.23 
 
 
311 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  44.87 
 
 
313 aa  247  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  40.38 
 
 
309 aa  241  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  40.72 
 
 
309 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12268  predicted protein  43.71 
 
 
311 aa  235  8e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812865  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  40.52 
 
 
307 aa  232  8.000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  40.51 
 
 
326 aa  220  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  37.99 
 
 
305 aa  215  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  34.2 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  37.99 
 
 
314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  38.64 
 
 
318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2169  ribonuclease Z  38.61 
 
 
323 aa  209  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  37.99 
 
 
318 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  34.53 
 
 
305 aa  208  8e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  34.31 
 
 
299 aa  207  3e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  38.18 
 
 
306 aa  204  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  39.06 
 
 
314 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  39.81 
 
 
328 aa  202  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  39.68 
 
 
307 aa  200  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  38.14 
 
 
321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  36.25 
 
 
303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  37.38 
 
 
319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  37.88 
 
 
309 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  34.3 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  36.16 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  37.42 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  39.64 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  33.33 
 
 
322 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  36.42 
 
 
319 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1592  ribonuclease Z  36 
 
 
306 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359546  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1561  ribonuclease Z  36 
 
 
306 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  39.46 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  33.22 
 
 
305 aa  188  9e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  34.88 
 
 
313 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  34.63 
 
 
304 aa  185  8e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1716  ribonuclease Z  35.78 
 
 
316 aa  183  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1554  ribonuclease Z  33.55 
 
 
317 aa  177  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  34.15 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  31.07 
 
 
301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  35.25 
 
 
310 aa  172  9e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  36.69 
 
 
308 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  32.13 
 
 
302 aa  169  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0738  ribonuclease Z  32.67 
 
 
304 aa  168  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0782  ribonuclease Z  32.31 
 
 
319 aa  167  2e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  34.89 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  35.02 
 
 
312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  31.85 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  34.87 
 
 
291 aa  162  8.000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  32.89 
 
 
308 aa  161  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  33.44 
 
 
313 aa  161  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>