More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0350 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  100 
 
 
304 aa  636    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  42.99 
 
 
316 aa  288  8e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1613  ribonuclease Z  42.72 
 
 
316 aa  285  8e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0540  Ribonuclease Z  42.48 
 
 
307 aa  247  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  39.54 
 
 
308 aa  228  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  34.31 
 
 
307 aa  171  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  34.98 
 
 
326 aa  169  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  32.89 
 
 
305 aa  169  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  36.82 
 
 
305 aa  169  6e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  33.45 
 
 
306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  34.95 
 
 
312 aa  165  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  32.57 
 
 
305 aa  160  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.19 
 
 
327 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  31.97 
 
 
299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.99 
 
 
312 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  32.65 
 
 
314 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  34.71 
 
 
309 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  35.51 
 
 
314 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  33.33 
 
 
310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  33.66 
 
 
314 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.65 
 
 
314 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  33.76 
 
 
319 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  32.57 
 
 
307 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0439  ribonuclease Z  34.81 
 
 
299 aa  149  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  33.12 
 
 
319 aa  149  6e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  32.25 
 
 
307 aa  149  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.64 
 
 
312 aa  149  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0782  ribonuclease Z  30.03 
 
 
319 aa  149  8e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  32.57 
 
 
307 aa  148  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  32.57 
 
 
307 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  32.25 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  32.25 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  32.25 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  32.25 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  32.25 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  31.62 
 
 
313 aa  145  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.03 
 
 
312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  33.01 
 
 
312 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  32.69 
 
 
307 aa  143  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  31.46 
 
 
345 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  31.46 
 
 
291 aa  143  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  31.6 
 
 
307 aa  143  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  30.03 
 
 
291 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  30.79 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  33 
 
 
318 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  33 
 
 
328 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1716  ribonuclease Z  30.58 
 
 
316 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  31.06 
 
 
302 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  31.7 
 
 
309 aa  138  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  29.79 
 
 
308 aa  138  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  32.57 
 
 
393 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  31.83 
 
 
305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  33.81 
 
 
312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1678  beta-lactamase domain-containing protein  32.56 
 
 
305 aa  135  7.000000000000001e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.554215  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  30.46 
 
 
321 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  31.14 
 
 
318 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  31.14 
 
 
318 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  31.17 
 
 
307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  29.11 
 
 
318 aa  130  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  27.81 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  29.76 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  28.24 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  29.55 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  30.92 
 
 
314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  30.92 
 
 
314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  29.67 
 
 
322 aa  126  5e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  27.39 
 
 
303 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  31.68 
 
 
305 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  31.67 
 
 
304 aa  123  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05331  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.72 
 
 
318 aa  122  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  29.47 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  29.47 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  29.57 
 
 
305 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  28.08 
 
 
314 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  29.57 
 
 
305 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  29.57 
 
 
305 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  30.32 
 
 
308 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  29.57 
 
 
305 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  28.85 
 
 
309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  31.62 
 
 
319 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  29.57 
 
 
305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  29.57 
 
 
305 aa  119  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  30.56 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  30.66 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  29.14 
 
 
311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  31.02 
 
 
306 aa  117  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12268  predicted protein  29.49 
 
 
311 aa  117  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812865  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  31.87 
 
 
319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  27.33 
 
 
309 aa  116  6e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  29.28 
 
 
305 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  29.28 
 
 
305 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  29.28 
 
 
305 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  29.28 
 
 
341 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  29.28 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0738  ribonuclease Z  26.89 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  29.47 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  26.17 
 
 
301 aa  114  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  27.57 
 
 
301 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1554  ribonuclease Z  29.79 
 
 
317 aa  113  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  31.02 
 
 
319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>