236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2705 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  100 
 
 		 280 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  47.19 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  47.55 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  48.29 
 
 		 323 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  34.48 
 
 		 312 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  34.48 
 
 		 312 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  34.48 
 
 		 312 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  34.48 
 
 		 312 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  34.1 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  34.36 
 
 		 280 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  30.92 
 
 		 283 aa  115  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  34.05 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  32.3 
 
 		 381 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  30.47 
 
 		 364 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  33.21 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  33.46 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  34.9 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  33.59 
 
 		 286 aa  102  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  31.62 
 
 		 319 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  32.41 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  31.23 
 
 		 321 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0205  hypothetical protein  30.6 
 
 		 395 aa  95.9  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3785  putative tRNA 3' processing RNase Z-like protein  30.49 
 
 		 393 aa  95.5  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  30.85 
 
 		 395 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  31.5 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17980  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  29.66 
 
 		 331 aa  93.6  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182434  normal  0.52881 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1722  beta-lactamase domain-containing protein  31.54 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261159  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5998  metal-dependent hydrolase  29.27 
 
 		 414 aa  88.6  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  30.12 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  30.12 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  30.12 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  28.36 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  28.68 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2459  beta-lactamase domain-containing protein  28.17 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  28.89 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  29.2 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13830  hypothetical protein  26.06 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.491323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  28.15 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0182  beta-lactamase-like protein  25.4 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.530565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  27.13 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  25 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  28.09 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  26.52 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  25.42 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  24.91 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  29.1 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  29.8 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  26.46 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1720  beta-lactamase-like  26.42 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.869413  normal  0.797394 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  25.87 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  26.46 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  26.46 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  26.46 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  26.46 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  32.04 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  26.85 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  26.07 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  26.46 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  26.07 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  25.19 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  26.46 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  24.58 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  29.61 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  25.39 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  28.05 
 
 		 328 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  26.72 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  26.46 
 
 		 307 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  26.8 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1592  ribonuclease Z  27.05 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359546  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  26.64 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1561  ribonuclease Z  27.05 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  23.31 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  25.88 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 		 243 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  23.32 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2136  beta-lactamase superfamily hydrolase  28.02 
 
 		 532 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  30.46 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  24.41 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  23.74 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  31.54 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  27.35 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0796  hypothetical protein  25 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030667 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  27.2 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  27.1 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  26.36 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  27.1 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  24.48 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  27.1 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  26.36 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  25.52 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2169  ribonuclease Z  21.07 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  23.59 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  25.49 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  24.7 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>