218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13830 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13830  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  758    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.491323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5998  metal-dependent hydrolase  43.15 
 
 		 414 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3785  putative tRNA 3' processing RNase Z-like protein  43.88 
 
 		 393 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0182  beta-lactamase-like protein  35.45 
 
 		 381 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.530565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0205  hypothetical protein  35.82 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17980  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  36.64 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182434  normal  0.52881 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  35.49 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  33.79 
 
 		 320 aa  154  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  34.57 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1722  beta-lactamase domain-containing protein  36.31 
 
 		 324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261159  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  31.25 
 
 		 334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  28.57 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  28.57 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  28.57 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  28.57 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  28.57 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  29.61 
 
 		 314 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  29.43 
 
 		 283 aa  107  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  29.58 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  29.79 
 
 		 323 aa  95.9  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  27.44 
 
 		 280 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  26.4 
 
 		 393 aa  87.8  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  26.61 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  29.22 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  26.6 
 
 		 300 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  25.54 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  26.36 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  26.32 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  26.04 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  26.38 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  26.94 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  24.23 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  26.2 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12268  predicted protein  26.25 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812865  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  25.84 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  27.62 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.2 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  23.59 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  24.5 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  26.8 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2169  ribonuclease Z  23.81 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2459  beta-lactamase domain-containing protein  24.49 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  28.12 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  25.4 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  23.31 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  25.98 
 
 		 314 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  25.6 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  24.92 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  24.76 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  24.44 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  22.9 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  26.16 
 
 		 314 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  27.15 
 
 		 395 aa  67  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  26.16 
 
 		 314 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  25.67 
 
 		 315 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  24.12 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  24.14 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  26.19 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  26.19 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  26.19 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  25.61 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  24.51 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.76 
 
 		 327 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  26.99 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  25.4 
 
 		 270 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  23.87 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  26.13 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.73 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  22.77 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  23.05 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  26.6 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  21.33 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  25.07 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  22.67 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  25.07 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11850  predicted protein  24.76 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  25.07 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  26.1 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  24.77 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  24.77 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  24.77 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  24.77 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  24.77 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  25.07 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  25.49 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0540  Ribonuclease Z  23.03 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  25.17 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  23.92 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.34 
 
 		 312 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  24.78 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  24.78 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  24.78 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  23.74 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  23.65 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  24.66 
 
 		 251 aa  57  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  24.41 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  23.64 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  24 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  24.25 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>