267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2355 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 319 aa  651    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  95.64 
 
 		 321 aa  607  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  88.2 
 
 		 320 aa  574  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  50.53 
 
 		 334 aa  276  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  44.83 
 
 		 314 aa  276  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5998  metal-dependent hydrolase  36.8 
 
 		 414 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  39.78 
 
 		 283 aa  199  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  39.12 
 
 		 312 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  39.12 
 
 		 312 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  39.12 
 
 		 312 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  39.12 
 
 		 312 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  39.12 
 
 		 312 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  35.14 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  37.45 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  38.35 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0205  hypothetical protein  35.01 
 
 		 395 aa  172  7.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3785  putative tRNA 3' processing RNase Z-like protein  35.94 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  36.81 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  36.11 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17980  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  34.8 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182434  normal  0.52881 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13830  hypothetical protein  32.96 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.491323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  35.4 
 
 		 323 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  33.45 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1722  beta-lactamase domain-containing protein  38.66 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261159  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  34.36 
 
 		 322 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0182  beta-lactamase-like protein  31.85 
 
 		 381 aa  136  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.530565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  32.87 
 
 		 364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  31.79 
 
 		 286 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  28.85 
 
 		 328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  32.14 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  34.77 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  34.77 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  34.77 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  32.25 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  28.76 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  31.62 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  26.79 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 		 263 aa  88.2  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  24.29 
 
 		 250 aa  82  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  25.45 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  25.87 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  27.94 
 
 		 244 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 257 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  25.4 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  29.14 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  26.06 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2459  beta-lactamase domain-containing protein  25.63 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  29.5 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  26.35 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  29.67 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  24.7 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  25.54 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  26.51 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  26.79 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  27.09 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  26.84 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  26.87 
 
 		 395 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  25.44 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  25.42 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  25.98 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  23.7 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  26.32 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  27.67 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2169  ribonuclease Z  23.78 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.33 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.7 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  23.27 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  25.09 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  25.09 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  25.09 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  25.77 
 
 		 248 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  25.09 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  25.09 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  25.64 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  23.34 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  25.56 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  26.5 
 
 		 255 aa  67  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  25.79 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  24.92 
 
 		 321 aa  67  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  23.41 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  23.41 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  23.4 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  24.91 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  21.99 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  23.05 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  23.05 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  25.66 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  23.05 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  23.05 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  23.05 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  23.05 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  27.31 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  23.05 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  24.73 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  27.15 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  25.78 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>