227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3238 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 323 aa  665    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  53.16 
 
 		 322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  50.93 
 
 		 323 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  48.29 
 
 		 280 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  32.06 
 
 		 312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  32.06 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  32.06 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  32.06 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  32.06 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  32.61 
 
 		 320 aa  119  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  32.25 
 
 		 319 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  31.52 
 
 		 321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  31.37 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  30.82 
 
 		 364 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  29.83 
 
 		 395 aa  105  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  29.82 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  31.54 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  29.85 
 
 		 283 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  31.64 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  27.88 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  29.2 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  29.85 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  27.74 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0205  hypothetical protein  29.05 
 
 		 395 aa  93.2  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  34.97 
 
 		 285 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  34.97 
 
 		 285 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  34.97 
 
 		 285 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3785  putative tRNA 3' processing RNase Z-like protein  28.21 
 
 		 393 aa  90.5  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5998  metal-dependent hydrolase  27.85 
 
 		 414 aa  87  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  31.05 
 
 		 243 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 		 263 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17980  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  27.69 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182434  normal  0.52881 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1722  beta-lactamase domain-containing protein  29.47 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261159  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2459  beta-lactamase domain-containing protein  26.13 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  33.92 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  30.33 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  27.95 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  27.59 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0182  beta-lactamase-like protein  24.39 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.530565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  29.19 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  23.02 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  25.76 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0796  hypothetical protein  29.82 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  27.23 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  24.9 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  31.94 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  25.25 
 
 		 244 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  24.84 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  30.68 
 
 		 262 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  25.74 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  31.35 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  26.28 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  26.8 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1592  ribonuclease Z  31.37 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359546  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  22.52 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1561  ribonuclease Z  31.37 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  30.24 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  27.03 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  27.8 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  30.28 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  25.97 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13830  hypothetical protein  23.47 
 
 		 375 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.491323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 256 aa  62.4  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  26.38 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  24.73 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  24.07 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0782  ribonuclease Z  31.03 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  24.24 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  25.97 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  23.23 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  28.37 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11850  predicted protein  26.92 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  23.28 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  30.33 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.27 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  26.69 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  24.41 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  26.55 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  21.98 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  21.98 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  29.62 
 
 		 257 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  26.06 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  30.43 
 
 		 250 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  26.1 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  21.61 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  21.61 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  21.61 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  21.61 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  21.61 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  26.35 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  26.71 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  30.15 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  21.61 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  24.47 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  22.45 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  30.92 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>