282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02203 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  100 
 
 		 334 aa  679    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  50.52 
 
 		 319 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  49.83 
 
 		 321 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  45.81 
 
 		 320 aa  288  7e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  46.43 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  41.69 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  41.69 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  41.69 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  41.69 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  41.36 
 
 		 312 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  38.27 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  38.93 
 
 		 288 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5998  metal-dependent hydrolase  33.08 
 
 		 414 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  31.99 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  35.61 
 
 		 337 aa  156  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0205  hypothetical protein  31.94 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13830  hypothetical protein  30.45 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.491323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17980  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  33.44 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182434  normal  0.52881 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  30.64 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  37.11 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3785  putative tRNA 3' processing RNase Z-like protein  30.53 
 
 		 393 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  32.63 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  32.31 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0182  beta-lactamase-like protein  30.52 
 
 		 381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.530565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  36.59 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  31.79 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  29 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  30.71 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  30.88 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1722  beta-lactamase domain-containing protein  30.03 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261159  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  31.07 
 
 		 364 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  34.9 
 
 		 280 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  32.97 
 
 		 285 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  32.97 
 
 		 285 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  32.97 
 
 		 285 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  30.71 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  25.25 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  23.31 
 
 		 314 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  28.52 
 
 		 244 aa  90.1  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  23.31 
 
 		 314 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  27.24 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 		 262 aa  85.9  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  26.06 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  25.71 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  29.66 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  25.76 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  26.13 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  25.08 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  30.6 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  24.75 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  24.75 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  24.75 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  24.75 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  24.75 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  27.21 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  23.55 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  24.41 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  24.41 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  22.9 
 
 		 393 aa  79.3  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  32.03 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  26.9 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  26.76 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  29.07 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  23.08 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11850  predicted protein  25.51 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  22.56 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  24.75 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  30.18 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2169  ribonuclease Z  26.1 
 
 		 323 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  28.09 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  25.6 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  25.95 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  25.9 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  25.25 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  30.04 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  26 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  23.31 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.23 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.14 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  24.84 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  27.71 
 
 		 256 aa  72  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  25.6 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  27.63 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  29.2 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  20.81 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12268  predicted protein  25.16 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812865  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2459  beta-lactamase domain-containing protein  23.64 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  23.43 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  25.16 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  27.7 
 
 		 270 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  29.71 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  23.69 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  29.14 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  24.9 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  21.88 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  22.14 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 		 255 aa  67  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>