170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2849 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  100 
 
 		 318 aa  653    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  29.28 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  24.64 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  25.84 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  30.1 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  28.33 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  30.1 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  30.1 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  30.1 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  24.91 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  29.77 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  29.34 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  22.99 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  26.8 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  25.91 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  29.5 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  27.24 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0182  beta-lactamase-like protein  27.48 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.530565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  26.25 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  27.59 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  30.27 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  27.18 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  25.81 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  23.26 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13830  hypothetical protein  27.75 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.491323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  28.12 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  27.73 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  25.97 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  25.82 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  25.09 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  24.5 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  26.23 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  26.49 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  26.28 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  27.7 
 
 		 255 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  26.14 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5998  metal-dependent hydrolase  25.57 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  28.03 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  25.9 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  27.75 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  27.75 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  27.75 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  25.85 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  24.45 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  24.73 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3785  putative tRNA 3' processing RNase Z-like protein  25.88 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  24.14 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  21.67 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  24.35 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  26.55 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  29.27 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  24.19 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  26.37 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  25.31 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  23.91 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  26.52 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  25.4 
 
 		 259 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  25.75 
 
 		 244 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  23.7 
 
 		 250 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  25.18 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  25.83 
 
 		 249 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  21.33 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  23.63 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  23.42 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  24.6 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  24.9 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  26.56 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 		 245 aa  54.3  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1373  beta-lactamase domain-containing protein  43.42 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1613  ribonuclease Z  25.58 
 
 		 316 aa  53.9  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1510  beta-lactamase domain protein  24.08 
 
 		 257 aa  53.9  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1678  beta-lactamase domain-containing protein  25.82 
 
 		 305 aa  53.5  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.554215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5275  beta-lactamase domain protein  25.7 
 
 		 263 aa  53.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  26.74 
 
 		 256 aa  53.1  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  27.05 
 
 		 246 aa  53.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  24.83 
 
 		 259 aa  53.1  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  35.51 
 
 		 247 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  26.45 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1628  metallo-beta-lactamase family protein  38.55 
 
 		 257 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  22.98 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  24.43 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2459  beta-lactamase domain-containing protein  23.91 
 
 		 421 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  27.2 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  24.8 
 
 		 244 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0205  hypothetical protein  26.19 
 
 		 395 aa  50.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  34.26 
 
 		 243 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  34.26 
 
 		 243 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  24.3 
 
 		 259 aa  50.1  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1662  Beta-lactamase-like  27.23 
 
 		 453 aa  49.7  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  28.08 
 
 		 453 aa  49.7  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  23.53 
 
 		 302 aa  49.7  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  22.81 
 
 		 306 aa  49.3  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  21.9 
 
 		 257 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  26.51 
 
 		 253 aa  49.3  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>