145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1510 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1510  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 257 aa  530  1e-150  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1628  metallo-beta-lactamase family protein  94.16 
 
 		 257 aa  505  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1373  beta-lactamase domain-containing protein  90.27 
 
 		 257 aa  489  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0787  beta-lactamase domain-containing protein  39.92 
 
 		 280 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0367408 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0801  beta-lactamase domain protein  41.3 
 
 		 288 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0750  Beta-lactamase-like  40.49 
 
 		 304 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0797  beta-lactamase domain protein  40.89 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0239083  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0751  beta-lactamase domain protein  39.43 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0809  beta-lactamase domain protein  39.57 
 
 		 277 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0810  hypothetical protein  36.65 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.960554  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0922  hypothetical protein  32.11 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000220742  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1330  hypothetical protein  29.53 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.493645  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2993  beta-lactamase domain-containing protein  30.82 
 
 		 328 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0235  hypothetical protein  28.97 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107264  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0588  hypothetical protein  27.38 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0654  hypothetical protein  29.67 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.142183  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1134  hypothetical protein  28.06 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.449288  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  24.58 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  27.65 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  23.48 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  28.06 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  22.49 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  25.35 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  23.22 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  24.81 
 
 		 323 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  23.97 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  23.69 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  25.34 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  27.41 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  23.3 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0621  hypothetical protein  25.3 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  25.11 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  23.98 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  23.29 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  24.08 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2269  beta-lactamase domain protein  25.6 
 
 		 306 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2229  ribonuclease Z  22.83 
 
 		 324 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  24.9 
 
 		 280 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  28 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  23.14 
 
 		 320 aa  53.1  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  23.6 
 
 		 334 aa  52.8  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  21.36 
 
 		 312 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  21.36 
 
 		 312 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  21.36 
 
 		 312 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  21.36 
 
 		 312 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  21.36 
 
 		 312 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  26.8 
 
 		 258 aa  52.8  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  24.62 
 
 		 270 aa  52.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  23.7 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  23.24 
 
 		 286 aa  52  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 		 240 aa  52.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  23.9 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  23.3 
 
 		 316 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  23.44 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  22.75 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  22.75 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  23.72 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  22.75 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  25.94 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  24.29 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1723  ribonuclease Z  27.17 
 
 		 287 aa  50.4  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00214675  decreased coverage  0.00000691229 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  22.66 
 
 		 321 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  23.22 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  24.81 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  22.27 
 
 		 244 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  26.05 
 
 		 259 aa  49.7  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  21.83 
 
 		 263 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  22.27 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  22.27 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0841  beta-lactamase-like protein  22.36 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000232036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0985  beta-lactamase-like protein  22.36 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000377257  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  25.64 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  22.33 
 
 		 243 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1059  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III  27.1 
 
 		 284 aa  49.3  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.623679  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  27.23 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  25.73 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  25.37 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  26.11 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  26.64 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  21.77 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  49.06 
 
 		 204 aa  47  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  23.25 
 
 		 254 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  23.36 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  27.03 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  26.87 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  22.71 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  21.8 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  24.36 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  23.98 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  30.53 
 
 		 310 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1441  beta-lactamase domain protein  21.77 
 
 		 330 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0828256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  23.35 
 
 		 245 aa  46.2  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  28.92 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  22.94 
 
 		 254 aa  45.8  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 		 246 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1887  beta-lactamase domain protein  23.33 
 
 		 273 aa  45.8  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000106131 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1103  RNAse Z  25.86 
 
 		 287 aa  45.4  0.0009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  26.38 
 
 		 272 aa  45.4  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>