183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1506 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
253 aa  505  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  50 
 
 
253 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  44.27 
 
 
248 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  37.01 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  34.78 
 
 
240 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  33.06 
 
 
240 aa  133  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5275  beta-lactamase domain protein  37.02 
 
 
263 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  36.02 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  34.14 
 
 
244 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  37.4 
 
 
245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  35.91 
 
 
270 aa  116  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  32.43 
 
 
249 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  29.23 
 
 
244 aa  113  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  34.62 
 
 
251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  34.06 
 
 
267 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  34.8 
 
 
262 aa  109  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  28.17 
 
 
244 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  28.17 
 
 
244 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  28.17 
 
 
244 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  28.17 
 
 
244 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  34.98 
 
 
257 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  35.27 
 
 
256 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  27.78 
 
 
244 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  33.08 
 
 
259 aa  105  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  33.85 
 
 
262 aa  105  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  27.78 
 
 
244 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  32.62 
 
 
273 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  28.17 
 
 
244 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  31.45 
 
 
250 aa  103  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 
259 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  28.17 
 
 
244 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  28.17 
 
 
244 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  32.82 
 
 
256 aa  101  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  31.08 
 
 
258 aa  101  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  32.73 
 
 
265 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  29.37 
 
 
267 aa  101  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 
253 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  27.38 
 
 
244 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  30.16 
 
 
244 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  34.73 
 
 
257 aa  99.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  32.3 
 
 
268 aa  99.4  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  32.46 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  32.68 
 
 
250 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  32.14 
 
 
265 aa  92.8  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  32.58 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  31.32 
 
 
249 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  29.92 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  28.14 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  34.04 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1059  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III  32 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.623679  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08360  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  28.42 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  31.54 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  31.69 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  29.12 
 
 
257 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  29.12 
 
 
257 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  29.12 
 
 
257 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  32.17 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  29.17 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  33.59 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  28.08 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4288  beta-lactamase-like protein  29.55 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09930  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  27.31 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.65106  normal  0.185671 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0738  ribonuclease Z  25.83 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  30.64 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  28 
 
 
318 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 
257 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  28.38 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  29.3 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  29.39 
 
 
265 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 
297 aa  63.5  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37507  predicted protein  30.18 
 
 
447 aa  63.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00696771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0914  ribonuclease Z  27.48 
 
 
307 aa  62.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 
255 aa  62.4  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0857  ribonuclease Z  27.48 
 
 
309 aa  62  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  31.27 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1441  beta-lactamase domain protein  26.62 
 
 
330 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0828256  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  24.68 
 
 
307 aa  60.1  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2269  beta-lactamase domain protein  27 
 
 
306 aa  59.7  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 
244 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 
244 aa  58.9  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  27.31 
 
 
263 aa  58.5  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  32.09 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1373  beta-lactamase domain-containing protein  26.99 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  25.89 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0190  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 
258 aa  57  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.41 
 
 
251 aa  56.6  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  27.14 
 
 
237 aa  56.6  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  24.51 
 
 
305 aa  56.2  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  29.57 
 
 
256 aa  56.2  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  24.43 
 
 
302 aa  55.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  22.26 
 
 
308 aa  55.5  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  25.1 
 
 
312 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  25.1 
 
 
312 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  25.1 
 
 
312 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  25.1 
 
 
312 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  27.59 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  22.19 
 
 
301 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  28.45 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  28.8 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>