232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29130 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  100 
 
 		 259 aa  520  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  55.91 
 
 		 270 aa  276  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  50.98 
 
 		 256 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  50.58 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  48.84 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  46.67 
 
 		 250 aa  229  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  48.84 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  46.72 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  49.23 
 
 		 257 aa  218  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  49.22 
 
 		 257 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  49.22 
 
 		 257 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  49.22 
 
 		 257 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  47.89 
 
 		 256 aa  215  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  48.09 
 
 		 273 aa  214  9e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  45.56 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  44.75 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4288  beta-lactamase-like protein  49.22 
 
 		 257 aa  203  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  43.54 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  47.27 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  43.97 
 
 		 249 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  49.02 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  48.05 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  44.27 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  43.77 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  42.39 
 
 		 245 aa  182  7e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  43.08 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  41.76 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  42.59 
 
 		 262 aa  175  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1059  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III  38.7 
 
 		 284 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.623679  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08360  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  40.58 
 
 		 271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  36.86 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09930  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  38.37 
 
 		 260 aa  155  8e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.65106  normal  0.185671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  38.52 
 
 		 265 aa  148  8e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  40.07 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  30.47 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  29.28 
 
 		 244 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  34.5 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  34.14 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  29.28 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  32.24 
 
 		 250 aa  122  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  36.82 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  28.9 
 
 		 244 aa  121  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  29.57 
 
 		 244 aa  121  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  28.14 
 
 		 244 aa  121  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  31.17 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  27.61 
 
 		 244 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  29.3 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  29.3 
 
 		 244 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  29.3 
 
 		 244 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  29.3 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  32.11 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  30 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  31.52 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 253 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  35.47 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  35.98 
 
 		 273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5275  beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 		 263 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  34.24 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  31.2 
 
 		 240 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  33.08 
 
 		 253 aa  99  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 		 285 aa  85.5  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  28.46 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  28.86 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  27.01 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  28.9 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2229  ribonuclease Z  25.99 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  26.69 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0914  ribonuclease Z  25.69 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  30.95 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  29.48 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  28.96 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2067  ribonuclease Z  26.98 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000376833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1128  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.39773 
 
 
-
 
NC_002620  TC0625  ribonuclease Z  23.93 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  26.44 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5799  ribonuclease Z  27.21 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0857  ribonuclease Z  25.35 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2269  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  25.64 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  28.02 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  24.12 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  26.05 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  28.09 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  25.33 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  29.72 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  23.67 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  25.44 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  28.91 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  26.42 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  26.42 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  25 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  26.42 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  26.42 
 
 		 341 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>