271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2251 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  100 
 
 		 273 aa  543  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  68.52 
 
 		 285 aa  336  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5275  beta-lactamase domain protein  35.9 
 
 		 263 aa  135  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  31.16 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  33.21 
 
 		 259 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  34.78 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  35.51 
 
 		 270 aa  122  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  36.71 
 
 		 262 aa  122  9e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  35.59 
 
 		 256 aa  122  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  36.16 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  33.45 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  34.77 
 
 		 250 aa  118  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  32.06 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  37.55 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  36.7 
 
 		 249 aa  116  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  34.39 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  34.05 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  37.09 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  32.26 
 
 		 248 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  35.98 
 
 		 259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  34.77 
 
 		 251 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  33.09 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  33.69 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  33.69 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  33.69 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  32.53 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  33.45 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  37.92 
 
 		 250 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  34.04 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  31.88 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  34.3 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  32.73 
 
 		 257 aa  105  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  32.59 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  26.35 
 
 		 244 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  29.09 
 
 		 253 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  33.1 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  31.77 
 
 		 246 aa  99.4  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  32.62 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  32.26 
 
 		 253 aa  96.3  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  27.24 
 
 		 244 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4288  beta-lactamase-like protein  32.13 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  26.49 
 
 		 244 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  29.34 
 
 		 240 aa  93.2  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  31.95 
 
 		 250 aa  92.4  7e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  27.34 
 
 		 244 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  27.34 
 
 		 244 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  27.34 
 
 		 244 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  27.34 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  27.34 
 
 		 244 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  26.01 
 
 		 244 aa  89.4  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  27.34 
 
 		 244 aa  89.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  29.5 
 
 		 251 aa  88.6  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  26.97 
 
 		 244 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 		 247 aa  87  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  26.22 
 
 		 244 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  26.59 
 
 		 244 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  29.09 
 
 		 240 aa  86.3  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  28 
 
 		 259 aa  85.5  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08360  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  30.3 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  28.73 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  28.21 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  30 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  28.27 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  25.83 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  27.82 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1059  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III  30.35 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.623679  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  27.46 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  29.62 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  29.62 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  29.62 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  29.62 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  29.62 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  29.62 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  29.62 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  27.12 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  29.81 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  29.33 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09930  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  30.18 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.65106  normal  0.185671 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  26.38 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  27.59 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  25.62 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  27.59 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  28.37 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  31.01 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0625  ribonuclease Z  27.47 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  26.21 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  27.33 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0796  hypothetical protein  30.62 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030667 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  26.83 
 
 		 235 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  30.03 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  29.92 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0857  ribonuclease Z  28.34 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  29.57 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  26.84 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5799  ribonuclease Z  27.21 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>