248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20060 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  100 
 
 
265 aa  529  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  51.35 
 
 
262 aa  245  6e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  47.17 
 
 
267 aa  240  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  45.39 
 
 
267 aa  223  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  45.04 
 
 
256 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08360  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  45.66 
 
 
271 aa  204  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09930  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  46.92 
 
 
260 aa  198  9e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.65106  normal  0.185671 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1059  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III  40.69 
 
 
284 aa  192  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.623679  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  44.28 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  44.19 
 
 
250 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  44.27 
 
 
259 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  43.63 
 
 
268 aa  186  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  44.22 
 
 
252 aa  185  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  40.7 
 
 
270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  43.75 
 
 
265 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  43.96 
 
 
257 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  42.69 
 
 
265 aa  178  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  40.7 
 
 
248 aa  178  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  44.02 
 
 
249 aa  176  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  45.23 
 
 
250 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  40.74 
 
 
270 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  43.63 
 
 
257 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  45.9 
 
 
246 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  42.32 
 
 
251 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  41.98 
 
 
257 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  41.98 
 
 
257 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  41.98 
 
 
257 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  38.85 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  40.54 
 
 
248 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  39.77 
 
 
273 aa  155  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4288  beta-lactamase-like protein  43.08 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  39.39 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  41.31 
 
 
248 aa  149  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  36.47 
 
 
245 aa  149  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  35.23 
 
 
257 aa  131  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  33.6 
 
 
244 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  33.86 
 
 
244 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  33.47 
 
 
244 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  33.47 
 
 
244 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  33.07 
 
 
244 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  32.4 
 
 
244 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  33.07 
 
 
244 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  33.47 
 
 
244 aa  122  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  33.07 
 
 
244 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  34.02 
 
 
244 aa  122  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  33.07 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  33.47 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  33.47 
 
 
240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  31.6 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  32.02 
 
 
256 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  29.53 
 
 
250 aa  106  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  30.38 
 
 
258 aa  106  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  32.3 
 
 
244 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  32.02 
 
 
262 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  33.1 
 
 
273 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  33.06 
 
 
246 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 
253 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5275  beta-lactamase domain protein  32.42 
 
 
263 aa  99.4  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  25.77 
 
 
240 aa  93.2  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
248 aa  92  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  29.7 
 
 
259 aa  86.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  31.33 
 
 
253 aa  85.5  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  35.1 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 
263 aa  79  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  25.81 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  26.75 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  26.45 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  28.3 
 
 
310 aa  63.5  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 
251 aa  63.5  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  25.59 
 
 
306 aa  63.5  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 
263 aa  62.4  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  24.54 
 
 
328 aa  62.4  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0988  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 
228 aa  62.4  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0914  ribonuclease Z  25.57 
 
 
307 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 
235 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  26.59 
 
 
283 aa  59.3  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0186  beta-lactamase domain-containing protein  26.25 
 
 
228 aa  58.5  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000106094  normal  0.0583426 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  23.23 
 
 
309 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  23.36 
 
 
307 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  29.48 
 
 
326 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 
235 aa  57  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5799  ribonuclease Z  25.72 
 
 
304 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0857  ribonuclease Z  24.27 
 
 
309 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  24.61 
 
 
314 aa  55.8  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 
243 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  23.36 
 
 
307 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  23.71 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  26.21 
 
 
308 aa  54.7  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  27.91 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  27.71 
 
 
255 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  22.85 
 
 
307 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  22.85 
 
 
307 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  22.85 
 
 
307 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1441  beta-lactamase domain protein  35.45 
 
 
330 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0828256  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>