174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09930 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_09930  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  100 
 
 
260 aa  525  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.65106  normal  0.185671 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  48.85 
 
 
265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  48.43 
 
 
262 aa  214  8e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  47.81 
 
 
256 aa  212  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  44.49 
 
 
267 aa  206  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  42.8 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  44.11 
 
 
265 aa  194  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  45.82 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  45.08 
 
 
257 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  42.8 
 
 
268 aa  188  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1059  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III  41.43 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.623679  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  42 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  42 
 
 
250 aa  182  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  45.02 
 
 
250 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  40.64 
 
 
251 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08360  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  42.97 
 
 
271 aa  181  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  42 
 
 
248 aa  179  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  41.63 
 
 
265 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  43.19 
 
 
265 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  40 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  40.15 
 
 
270 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  37.8 
 
 
252 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  37.96 
 
 
245 aa  156  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  41.28 
 
 
246 aa  145  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  38.25 
 
 
248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  40.5 
 
 
257 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  39.26 
 
 
257 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  39.26 
 
 
257 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  39.26 
 
 
257 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  36.61 
 
 
253 aa  139  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  38.13 
 
 
256 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  39.04 
 
 
248 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4288  beta-lactamase-like protein  40.08 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  36.21 
 
 
273 aa  131  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  32.16 
 
 
244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  28.3 
 
 
244 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  28.3 
 
 
244 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  28.3 
 
 
244 aa  109  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  27.92 
 
 
244 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  27.92 
 
 
244 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  28.3 
 
 
244 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  27.17 
 
 
244 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  27.92 
 
 
244 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  28.3 
 
 
244 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 
244 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  33.2 
 
 
244 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  31.98 
 
 
256 aa  105  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  31.3 
 
 
262 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  28.03 
 
 
244 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  30.2 
 
 
257 aa  99  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 
240 aa  97.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  31.54 
 
 
250 aa  96.3  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  30.52 
 
 
246 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  32.22 
 
 
258 aa  95.1  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  26.14 
 
 
240 aa  89.4  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  26.56 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  30.91 
 
 
273 aa  82  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  33.91 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  28.11 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5275  beta-lactamase domain protein  26.17 
 
 
263 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  26.87 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  27.13 
 
 
283 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  26.87 
 
 
243 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  25.89 
 
 
259 aa  61.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  25.51 
 
 
248 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  28.85 
 
 
251 aa  60.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  27.41 
 
 
285 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  42.72 
 
 
318 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  27.27 
 
 
276 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  40.78 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  25.33 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  41.75 
 
 
318 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  28.23 
 
 
251 aa  55.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  23.84 
 
 
308 aa  54.7  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  26.74 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  28.1 
 
 
237 aa  53.5  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  25.75 
 
 
243 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  26.25 
 
 
288 aa  53.1  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5799  ribonuclease Z  27.45 
 
 
304 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  27.04 
 
 
256 aa  52.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0563  beta-lactamase domain-containing protein  30.27 
 
 
248 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  24.73 
 
 
341 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0700  beta-lactamase domain protein  23.99 
 
 
270 aa  52  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  25.72 
 
 
314 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  24.73 
 
 
305 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  30.46 
 
 
252 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  24.73 
 
 
305 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  24.73 
 
 
305 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  24.73 
 
 
341 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  27.65 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  27.75 
 
 
244 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  26.58 
 
 
328 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  27.11 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  28.89 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  28.05 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>