220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3358 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 255 aa  527  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0922  beta-lactamase domain protein  54.12 
 
 		 259 aa  280  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2128  beta-lactamase-like protein  51.97 
 
 		 254 aa  265  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  48.83 
 
 		 254 aa  242  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4676  cyclic-AMP phosphodiesterase  50.21 
 
 		 263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3939  beta-lactamase-like  48.95 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0190  beta-lactamase domain-containing protein  43.85 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5186  beta-lactamase domain protein  47.47 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  44.17 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0960  cyclic-AMP phosphodiesterase  41.41 
 
 		 267 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.160022 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0066  cAMP phosphodiesterase  43.85 
 
 		 267 aa  205  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0298  cyclic-AMP phosphodiesterase  43.88 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0134  cyclic-AMP phosphodiesterase  37.4 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  36.96 
 
 		 252 aa  178  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  37.45 
 
 		 262 aa  175  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  40.83 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4089  beta-lactamase domain-containing protein  41.23 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.923622  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  40.51 
 
 		 252 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 		 796 aa  139  6e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0426  metallo-beta-lactamase family protein  29.91 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_367  metallo-beta-lactamase  29.05 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.523669  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0402  hypothetical protein  28.95 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.424061  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0381  cyclic-AMP phosphodiesterase  28.23 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3587  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  27.94 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1164  cyclic-AMP phosphodiesterase  27.94 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1113  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  27.45 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000266448  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1253  cyclic-AMP phosphodiesterase  28.69 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0807083  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1607  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  26.47 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  23.44 
 
 		 295 aa  67  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  28.78 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1224  cyclic-AMP phosphodiesterase  27.34 
 
 		 319 aa  65.5  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  26.32 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4352  cyclic-AMP phosphodiesterase  26.24 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  0.0439524 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  26.06 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  24.63 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  29.48 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0338  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.99 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  22.22 
 
 		 243 aa  62  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  30.39 
 
 		 322 aa  62  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  26.91 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  27.38 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  26.37 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1916  hypothetical protein  25 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  30 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1926  hypothetical protein  24.02 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  24.79 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  26.42 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  27.21 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  26.27 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1625  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  21.57 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0207595  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  25.97 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  25.71 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  27.35 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  30.11 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  27.57 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  25.81 
 
 		 306 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  23.08 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  26.92 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  27.57 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  28.51 
 
 		 453 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  25.53 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  26.63 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  32.18 
 
 		 364 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  29.14 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  26.05 
 
 		 246 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0893  beta-lactamase domain-containing protein  29.46 
 
 		 278 aa  52.4  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0178503  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  28.41 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  26.75 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  26.82 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  22.03 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84281  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase (PDEase) (3':5'-CNP)  34.94 
 
 		 384 aa  51.6  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.292629  normal  0.400104 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  26.67 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  28.78 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  20.52 
 
 		 305 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  21.46 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  27.2 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09930  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  27.65 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.65106  normal  0.185671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00829  cAMP-specific phosphodiesterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14890)  33.72 
 
 		 561 aa  50.1  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  24.84 
 
 		 314 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  27.75 
 
 		 395 aa  50.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1316  phosphonate metabolism protein PhnP  24.24 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  25 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  24.86 
 
 		 240 aa  50.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  23.87 
 
 		 322 aa  49.7  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  22.03 
 
 		 294 aa  49.3  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  29.24 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  21.79 
 
 		 305 aa  49.7  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  27.93 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  24.71 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  25.31 
 
 		 305 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  25.31 
 
 		 305 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>