35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0381 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0381  cyclic-AMP phosphodiesterase  100 
 
 
329 aa  663    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1113  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  55.19 
 
 
345 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000266448  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1164  cyclic-AMP phosphodiesterase  55.19 
 
 
345 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3587  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  54.87 
 
 
345 aa  367  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1253  cyclic-AMP phosphodiesterase  51.67 
 
 
326 aa  340  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0807083  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1607  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  53.23 
 
 
330 aa  331  9e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0338  cyclic-AMP phosphodiesterase  44.55 
 
 
339 aa  280  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4352  cyclic-AMP phosphodiesterase  43.45 
 
 
316 aa  265  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  0.0439524 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1224  cyclic-AMP phosphodiesterase  42.51 
 
 
319 aa  263  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1926  hypothetical protein  36.34 
 
 
327 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1916  hypothetical protein  36.67 
 
 
327 aa  225  6e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1625  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  36.91 
 
 
331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0207595  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84281  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase (PDEase) (3':5'-CNP)  29.54 
 
 
384 aa  118  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.292629  normal  0.400104 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00829  cAMP-specific phosphodiesterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14890)  29.22 
 
 
561 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  28.23 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  27.67 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0298  cyclic-AMP phosphodiesterase  24.91 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4089  beta-lactamase domain-containing protein  24.02 
 
 
255 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.923622  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0190  beta-lactamase domain-containing protein  23.49 
 
 
258 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.73 
 
 
255 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.27 
 
 
254 aa  60.1  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 
262 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2128  beta-lactamase-like protein  26.34 
 
 
254 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  25.09 
 
 
796 aa  56.2  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  24.51 
 
 
252 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0960  cyclic-AMP phosphodiesterase  23.67 
 
 
267 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.160022 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  23.3 
 
 
252 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4676  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.37 
 
 
263 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0922  beta-lactamase domain protein  22.92 
 
 
259 aa  50.4  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05390  cAMP-specific phosphodiesterase, putative  32.08 
 
 
464 aa  50.4  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0066  cAMP phosphodiesterase  26.15 
 
 
267 aa  49.7  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_002936  DET0426  metallo-beta-lactamase family protein  23.4 
 
 
258 aa  47.4  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5186  beta-lactamase domain protein  21.43 
 
 
267 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0402  hypothetical protein  24.14 
 
 
258 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.424061  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_367  metallo-beta-lactamase  23.7 
 
 
258 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.523669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>