136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0984 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  100 
 
 		 254 aa  510  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2128  beta-lactamase-like protein  50.39 
 
 		 254 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0922  beta-lactamase domain protein  47.45 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  48.83 
 
 		 255 aa  242  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0960  cyclic-AMP phosphodiesterase  43.53 
 
 		 267 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.160022 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  43.14 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0066  cAMP phosphodiesterase  44.87 
 
 		 267 aa  201  7e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0134  cyclic-AMP phosphodiesterase  34.65 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4676  cyclic-AMP phosphodiesterase  41.6 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5186  beta-lactamase domain protein  43.02 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0190  beta-lactamase domain-containing protein  40.55 
 
 		 258 aa  185  8e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3939  beta-lactamase-like  41.6 
 
 		 263 aa  183  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0298  cyclic-AMP phosphodiesterase  41.39 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  34.9 
 
 		 252 aa  145  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  37.71 
 
 		 252 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  35.84 
 
 		 796 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  37.39 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4089  beta-lactamase domain-containing protein  33.85 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.923622  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  35.82 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0426  metallo-beta-lactamase family protein  26.72 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0402  hypothetical protein  25.29 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.424061  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_367  metallo-beta-lactamase  27.6 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.523669  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0381  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.27 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  42.05 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0893  beta-lactamase domain-containing protein  32.61 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0178503  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  31.22 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  27.73 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  27.09 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1113  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  27.91 
 
 		 345 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000266448  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1164  cyclic-AMP phosphodiesterase  27.91 
 
 		 345 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1253  cyclic-AMP phosphodiesterase  27.88 
 
 		 326 aa  53.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0807083  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3587  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  37.29 
 
 		 345 aa  53.1  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 		 244 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1224  cyclic-AMP phosphodiesterase  27.36 
 
 		 319 aa  52.8  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  30.13 
 
 		 309 aa  52.8  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3244  beta-lactamase superfamily hydrolase  29.17 
 
 		 255 aa  52  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  30.07 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  28.14 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3675  beta-lactamase domain protein  29.45 
 
 		 335 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291829  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  27.42 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  25.85 
 
 		 301 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  31.41 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  26.47 
 
 		 296 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  31.22 
 
 		 244 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  26.11 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  28.21 
 
 		 314 aa  48.9  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4352  cyclic-AMP phosphodiesterase  25 
 
 		 316 aa  48.9  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  0.0439524 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00829  cAMP-specific phosphodiesterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14890)  39.34 
 
 		 561 aa  48.9  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  29.57 
 
 		 455 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  26.27 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0338  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.88 
 
 		 339 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  25.21 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  24.73 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  29.57 
 
 		 455 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0063  ribonuclease Z  31.65 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.253794  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  26.27 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  33.15 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  31.51 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  22.89 
 
 		 422 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  24.57 
 
 		 304 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1625  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  24.28 
 
 		 331 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0207595  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  29.58 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0063  ribonuclease Z  30.94 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.715887  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1423  beta-lactamase domain-containing protein  43.33 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.408877  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  28.26 
 
 		 297 aa  46.6  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1916  hypothetical protein  24.51 
 
 		 327 aa  46.6  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  38.16 
 
 		 328 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  26.27 
 
 		 455 aa  46.6  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0019  beta-lactamase-like protein  38.36 
 
 		 813 aa  46.6  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 454 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  25.32 
 
 		 305 aa  46.2  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  25.13 
 
 		 280 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  23.32 
 
 		 451 aa  46.2  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  29.28 
 
 		 244 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  25.11 
 
 		 411 aa  45.8  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2593  cyclic nucleotide-binding protein  31.5 
 
 		 707 aa  45.8  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223415 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  30.13 
 
 		 323 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  29.28 
 
 		 244 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  35.42 
 
 		 302 aa  45.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  32.73 
 
 		 308 aa  45.4  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 453 aa  45.4  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  27.93 
 
 		 244 aa  45.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  26.63 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1926  hypothetical protein  37.31 
 
 		 327 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  29.41 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  25.53 
 
 		 452 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  31.37 
 
 		 315 aa  44.7  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 285 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3172  beta-lactamase superfamily hydrolase  29.51 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  24.86 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  26.22 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3913  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89936  predicted protein  24.87 
 
 		 793 aa  44.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.731556  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1789  cobalbumin biosynthesis protein  34.12 
 
 		 471 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.782368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  27 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  29.28 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  25.34 
 
 		 395 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>