97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2593 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2593  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
707 aa  1431    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223415 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44387  predicted protein  31.08 
 
 
1343 aa  102  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  27.15 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2454  cyclic nucleotide-binding protein  21.63 
 
 
871 aa  67.4  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11563  predicted protein  23.88 
 
 
238 aa  67  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684972  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1735  cyclic nucleotide-binding protein  24.46 
 
 
739 aa  65.5  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00308523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  31.4 
 
 
425 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  27.35 
 
 
255 aa  59.3  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.4 
 
 
425 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  26.09 
 
 
251 aa  58.9  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 
255 aa  58.9  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10848  predicted protein  23.36 
 
 
261 aa  58.2  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.69 
 
 
503 aa  57.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  31.41 
 
 
244 aa  57.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  29.47 
 
 
247 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  27.6 
 
 
243 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1103  RNAse Z  31.13 
 
 
287 aa  55.5  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82287  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit)  24.89 
 
 
441 aa  55.5  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.770378 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 
263 aa  54.7  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  29.86 
 
 
323 aa  54.3  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  31.03 
 
 
304 aa  53.9  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  34.31 
 
 
1048 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 
243 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  24.42 
 
 
257 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  25.79 
 
 
528 aa  52.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  26.82 
 
 
254 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04987  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O59922]  28.26 
 
 
412 aa  52.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.599779  normal  0.51731 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  27.72 
 
 
237 aa  52  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0796  hypothetical protein  33.96 
 
 
244 aa  51.6  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030667 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3727  cyclic nucleotide-binding protein  31.09 
 
 
167 aa  50.8  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.03 
 
 
228 aa  50.8  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  28.18 
 
 
322 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  36.04 
 
 
244 aa  50.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  27.22 
 
 
243 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1383  ribonuclease Z  35.21 
 
 
287 aa  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.409103  normal  0.0217204 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  28.07 
 
 
308 aa  49.7  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5210  cyclic nucleotide-binding protein  26.19 
 
 
355 aa  50.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.465426  normal  0.688608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  27.62 
 
 
243 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  24.54 
 
 
307 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  24.54 
 
 
307 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3246  hypothetical protein  28.18 
 
 
283 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3000  hypothetical protein  28.18 
 
 
282 aa  48.1  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115353  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29662  predicted protein  26.67 
 
 
680 aa  48.1  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.226582  normal  0.0425728 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27248  predicted protein  26.67 
 
 
680 aa  48.1  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.2735 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  36.51 
 
 
244 aa  48.5  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  28.78 
 
 
311 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  23.53 
 
 
307 aa  47.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  23.53 
 
 
307 aa  47.8  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  23.53 
 
 
307 aa  47.8  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  23.53 
 
 
307 aa  47.8  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  23.53 
 
 
307 aa  47.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  23.81 
 
 
307 aa  47  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2937  metal-dependent hydrolase  28.18 
 
 
287 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf128  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.87 
 
 
594 aa  47.4  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0563  beta-lactamase domain-containing protein  27.32 
 
 
248 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0405  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 
287 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.945649  normal  0.820015 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2956  beta-lactamase domain-containing protein  28.18 
 
 
283 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0379847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3015  hypothetical protein  27.27 
 
 
287 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  32.18 
 
 
246 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  24.08 
 
 
249 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  23.81 
 
 
307 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3247  hypothetical protein  27.27 
 
 
283 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2926  hypothetical protein  38.98 
 
 
721 aa  46.6  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 
323 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0235  hypothetical protein  26.76 
 
 
266 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107264  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4676  cyclic-AMP phosphodiesterase  24.62 
 
 
263 aa  45.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  32.93 
 
 
1065 aa  45.4  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_4561  predicted protein  28.69 
 
 
121 aa  45.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3069  hypothetical protein  38.98 
 
 
721 aa  45.8  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1780  cyclic nucleotide-binding protein  32.69 
 
 
156 aa  45.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  31.5 
 
 
254 aa  45.8  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1723  ribonuclease Z  33.98 
 
 
287 aa  45.8  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00214675  decreased coverage  0.00000691229 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2270  cyclic nucleotide-binding protein  26.44 
 
 
477 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166052 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  28.06 
 
 
305 aa  45.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  25.25 
 
 
248 aa  45.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  30.89 
 
 
164 aa  45.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.12 
 
 
236 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  28.06 
 
 
305 aa  45.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  29.48 
 
 
244 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  28.06 
 
 
305 aa  45.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  28.06 
 
 
311 aa  45.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  28.06 
 
 
305 aa  45.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  26.23 
 
 
308 aa  45.1  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  23.79 
 
 
307 aa  45.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  28.06 
 
 
305 aa  45.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  33.33 
 
 
316 aa  44.7  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  28.06 
 
 
305 aa  45.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3027  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 
268 aa  44.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 
247 aa  44.7  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3913  beta-lactamase domain-containing protein  28.71 
 
 
283 aa  44.7  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  28.99 
 
 
311 aa  44.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1186  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.52 
 
 
553 aa  44.7  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  29.66 
 
 
167 aa  44.3  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1939  beta-lactamase domain protein  27.06 
 
 
555 aa  44.3  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.73 
 
 
251 aa  44.3  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0745  cyclic nucleotide-binding protein  30.83 
 
 
837 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.274315  normal  0.0506496 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  23.53 
 
 
561 aa  43.9  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>