More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0745 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3536  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  67.14 
 
 
841 aa  1149    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1527  nitrogen assimilation regulatory protein  55.63 
 
 
838 aa  882    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000360333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0745  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
837 aa  1699    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.274315  normal  0.0506496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3607  cyclic nucleotide-binding protein  65.04 
 
 
841 aa  1114    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.29767 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29251  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  42.92 
 
 
695 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2565  sigma-54 factor  44.58 
 
 
662 aa  467  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.289153  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3683  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.97 
 
 
476 aa  208  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  27.67 
 
 
857 aa  204  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  25.71 
 
 
860 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2488  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.41 
 
 
462 aa  196  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3534  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.49 
 
 
476 aa  196  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.613283 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3170  cyclic nucleotide-binding protein  26.09 
 
 
785 aa  189  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0158223  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  25.41 
 
 
918 aa  111  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2797  putative sigma54 specific transcriptional regulator  31.6 
 
 
512 aa  107  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1451  cyclic nucleotide-binding protein  30.45 
 
 
516 aa  107  9e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0424  Sigma 54 interacting domain protein  29.48 
 
 
533 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1966  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  29.75 
 
 
526 aa  104  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0868  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.91 
 
 
475 aa  103  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0975  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  32.63 
 
 
457 aa  101  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1034  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  33.05 
 
 
449 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2020  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  32.63 
 
 
466 aa  100  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29433  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1037  putative sigma54 specific transcriptional regulator  33.05 
 
 
449 aa  100  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349182  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0103  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  30.08 
 
 
519 aa  99.8  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000150576  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0444  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  32.5 
 
 
482 aa  100  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1977  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.46 
 
 
447 aa  99  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2807  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.3 
 
 
466 aa  98.6  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.75933  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3245  Sigma 54 interacting domain protein  29.29 
 
 
512 aa  99  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1397  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.76 
 
 
458 aa  98.2  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1699  acetoin operon expression regulatory protein  30.89 
 
 
671 aa  97.4  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.263456  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1613  Sigma 54 interacting domain protein  29.01 
 
 
532 aa  96.7  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2688  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  27.46 
 
 
597 aa  95.9  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3823  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  28.78 
 
 
517 aa  95.9  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3291  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.47 
 
 
470 aa  95.5  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00624459  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3097  two component Fis family transcriptional regulator  31.28 
 
 
535 aa  95.1  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2242  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.22 
 
 
464 aa  95.1  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.719582 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0294  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  29.07 
 
 
455 aa  94.7  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0358  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  29.41 
 
 
455 aa  94.7  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0355  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  29.07 
 
 
455 aa  94.7  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0197  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  27.6 
 
 
1098 aa  94.4  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.793641  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3620  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.67 
 
 
449 aa  94.4  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351229  hitchhiker  0.00000838354 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0311  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  29.07 
 
 
455 aa  94  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0298  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  29.07 
 
 
455 aa  94  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0326  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  29.07 
 
 
455 aa  94  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2692  putative sigma54 specific transcriptional regulator  28.73 
 
 
532 aa  94  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.152723  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2679  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.13 
 
 
486 aa  93.6  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.319369 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0352  putative sigma54 specific transcriptional regulator  31.36 
 
 
554 aa  94  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49020  sigma54-dependent transcriptional activator for the iron only nitrogenase, AnfA  29.06 
 
 
537 aa  94  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0365  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.36 
 
 
554 aa  94  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1926  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  27.78 
 
 
575 aa  93.6  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0306  putative sigma54 specific transcriptional regulator  28.47 
 
 
455 aa  94  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0326  NifA subfamily transcriptional regulator  27.88 
 
 
733 aa  92.8  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.399529  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0338  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  32.27 
 
 
552 aa  93.2  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0023  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  29.83 
 
 
319 aa  92.8  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1348  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.78 
 
 
461 aa  93.2  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2163  sigma54 specific transcriptional regulator with PAS/PAC sensor, Fis family  29.66 
 
 
575 aa  92.8  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1760  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.44 
 
 
470 aa  92.8  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1080  Sigma 54 interacting domain protein  29 
 
 
512 aa  92.4  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171864  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0304  putative PAS/PAC sensor protein  27.53 
 
 
459 aa  92.4  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3709  sigma-54 factor, interaction region  30 
 
 
457 aa  92.8  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2812  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.69 
 
 
466 aa  92.4  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0671  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.39 
 
 
457 aa  92.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2284  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.74 
 
 
488 aa  92  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0515  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  29.22 
 
 
623 aa  91.7  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000178347  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1287  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.34 
 
 
452 aa  92  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.541874  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0674  two-component response regulator CbrB  30.08 
 
 
453 aa  91.7  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0916838  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1545  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.68 
 
 
478 aa  91.7  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.224359  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0400  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  28.72 
 
 
455 aa  91.3  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0351818  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3647  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.42 
 
 
451 aa  91.3  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1185  NifA subfamily transcriptional regulator  29.01 
 
 
670 aa  90.9  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.132433 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4873  putative sigma54 specific transcriptional regulator  29.52 
 
 
483 aa  90.9  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1208  two component signal transduction response regulator  28.94 
 
 
470 aa  90.1  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0354694  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1266  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  29.49 
 
 
724 aa  90.1  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4153  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29 
 
 
466 aa  90.5  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0306  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  29.29 
 
 
657 aa  90.1  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.715643  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0456  hypothetical protein  28.78 
 
 
586 aa  90.5  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2638  hydrogenase-4 transcriptional regulator  28.67 
 
 
670 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0760  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  28.44 
 
 
525 aa  90.1  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3375  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.46 
 
 
461 aa  90.9  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2724  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  29.91 
 
 
723 aa  90.5  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00255153  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02345  hypothetical protein  28.67 
 
 
670 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1719  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  28.83 
 
 
582 aa  90.5  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02383  DNA-binding transcriptional activator, formate sensing  28.67 
 
 
668 aa  90.1  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1319  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.52 
 
 
452 aa  90.1  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1178  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  28.67 
 
 
670 aa  90.1  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1375  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  32.49 
 
 
644 aa  89.4  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3890  helix-turn-helix, Fis-type  28.33 
 
 
577 aa  90.1  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506447  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1206  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  27.56 
 
 
516 aa  90.1  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.628402  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1800  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.21 
 
 
464 aa  89.7  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.458412  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5108  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  27.68 
 
 
684 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3375  two-component response regulator CbrB  29.17 
 
 
472 aa  90.1  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0307811  normal  0.146362 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2773  formate hydrogenlyase transcriptional activator  30 
 
 
670 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.309926  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3356  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.82 
 
 
484 aa  89.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1014  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  27.94 
 
 
645 aa  89.7  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33440  sigma54-dependent activator protein  28.83 
 
 
493 aa  90.1  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2843  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.24 
 
 
547 aa  90.1  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4853  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.08 
 
 
457 aa  90.1  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231814  hitchhiker  0.00735887 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0020  sigma-54 dependent transcriptional regulator  29.03 
 
 
530 aa  89.7  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3713  formate hydrogenlyase transcriptional activator  28.67 
 
 
670 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.574322  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0372  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  27.78 
 
 
455 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0074  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.91 
 
 
453 aa  89.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>