186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0275 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  100 
 
 		 918 aa  1898    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1371  polyferredoxin-like protein  38.33 
 
 		 474 aa  380  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1993  hypothetical protein  36.34 
 
 		 452 aa  329  2.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0783  polyferredoxin-like protein  30.59 
 
 		 336 aa  174  6.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0502  hypothetical protein  47.83 
 
 		 158 aa  128  5e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1552  hypothetical protein  46.53 
 
 		 232 aa  128  5e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0038009  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  35.24 
 
 		 364 aa  112  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3607  cyclic nucleotide-binding protein  25.52 
 
 		 841 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.29767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3536  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.74 
 
 		 841 aa  111  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  40.69 
 
 		 350 aa  107  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1656  hypothetical protein  23.81 
 
 		 452 aa  100  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  41.22 
 
 		 378 aa  100  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  44.8 
 
 		 364 aa  97.4  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0745  cyclic nucleotide-binding protein  26.19 
 
 		 837 aa  95.5  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.274315  normal  0.0506496 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1527  nitrogen assimilation regulatory protein  24.73 
 
 		 838 aa  90.1  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360333 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2488  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.3 
 
 		 462 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1400  putative nitrogen fixation protein VnfA  26.57 
 
 		 464 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11103  normal  0.0950642 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3683  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.8 
 
 		 476 aa  86.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2032  hypothetical protein  26.57 
 
 		 466 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0609  hypothetical protein  26.09 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398547  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0511  hypothetical protein  24.28 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0884  hypothetical protein  26.09 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1924  nitrogen fixation protein VnfA  26.09 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1743  hypothetical protein  26.09 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0676107  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0011  hypothetical protein  26.09 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0911  hypothetical protein  26.09 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1954  putative nitrogen fixation protein VnfA  26.57 
 
 		 469 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1071  polyferredoxin-like protein  27.54 
 
 		 465 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29251  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  24.83 
 
 		 695 aa  82.8  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2230  polyferredoxin-like protein  28.02 
 
 		 465 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2565  sigma-54 factor  26.26 
 
 		 662 aa  81.3  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.289153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3149  putative nitrogen fixation protein VnfA  26.09 
 
 		 468 aa  81.3  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.604637  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5871  polyferredoxin-like  28.02 
 
 		 465 aa  81.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2206  polyferredoxin-like protein  28.02 
 
 		 465 aa  81.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5534  polyferredoxin-like  27.54 
 
 		 465 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2123  polyferredoxin-like protein  26.57 
 
 		 465 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.334313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2244  polyferredoxin-like protein  26.57 
 
 		 465 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3170  cyclic nucleotide-binding protein  27.12 
 
 		 785 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0158223  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1109  putative regulatory protein  24.05 
 
 		 463 aa  76.3  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.414253  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  21.96 
 
 		 860 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0384  hypothetical protein  23.71 
 
 		 477 aa  72.4  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3534  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.62 
 
 		 476 aa  72  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.613283 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3247  hypothetical protein  25.74 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0332  hypothetical protein  23.71 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1451  cyclic nucleotide-binding protein  23.29 
 
 		 516 aa  69.7  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  19.95 
 
 		 857 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0392  hypothetical protein  24.27 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3606  nitrogen fixation protein VnfA  23.77 
 
 		 461 aa  67.4  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.331622  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1475  hypothetical protein  33.9 
 
 		 170 aa  66.6  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4288  hypothetical protein  23.74 
 
 		 471 aa  66.6  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0607453  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3291  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.29 
 
 		 470 aa  65.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00624459  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0428  hypothetical protein  24.62 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2084  hypothetical protein  24.62 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3801  hypothetical protein  23.95 
 
 		 477 aa  64.7  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0435809  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2352  polyferredoxin-like protein  23.83 
 
 		 438 aa  63.9  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1973  riboflavin biosynthesis protein ribAB  28.22 
 
 		 270 aa  63.5  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.220327  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1426  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.59 
 
 		 228 aa  62.4  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3630  hypothetical protein  22.03 
 
 		 474 aa  62  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00502149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2815  hypothetical protein  31.09 
 
 		 174 aa  62  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.65 
 
 		 232 aa  62  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000222654  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1283  hypothetical protein  26.74 
 
 		 185 aa  61.6  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0576  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.47 
 
 		 258 aa  60.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1073  FMN-binding domain-containing protein  24.89 
 
 		 712 aa  60.5  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.537433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3635  hypothetical protein  36.78 
 
 		 172 aa  60.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0793  hypothetical protein  37.5 
 
 		 184 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3585  hypothetical protein  35.63 
 
 		 172 aa  60.1  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20230  regulatory protein NosR  25.11 
 
 		 715 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578726 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1482  FMN-binding domain-containing protein  26.07 
 
 		 886 aa  58.5  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1835  hypothetical protein  30.15 
 
 		 188 aa  58.5  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.74509  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0806  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.65 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0103679  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.18 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.523499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3066  hypothetical protein  39.53 
 
 		 119 aa  57.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1739  regulatory protein NosR  25.11 
 
 		 715 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  24.64 
 
 		 357 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.64 
 
 		 357 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.57 
 
 		 368 aa  57  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2563  FMN-binding domain protein  25.96 
 
 		 714 aa  56.6  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.132297  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.64 
 
 		 357 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  24.64 
 
 		 357 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  24.64 
 
 		 357 aa  57  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0832  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.09 
 
 		 314 aa  56.2  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.64 
 
 		 357 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1409  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.88 
 
 		 257 aa  55.8  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4220  FMN-binding domain-containing protein  25.68 
 
 		 726 aa  56.2  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3079  FMN-binding domain-containing protein  27.68 
 
 		 714 aa  56.2  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.86 
 
 		 229 aa  56.2  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.35 
 
 		 233 aa  56.2  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310265  normal  0.576374 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0798  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.09 
 
 		 356 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223587  hitchhiker  0.00276018 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2604  iron-sulfur cluster-binding protein  24.75 
 
 		 339 aa  55.5  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3053  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  24.87 
 
 		 272 aa  55.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17811 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.53 
 
 		 356 aa  54.7  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.232624  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0547  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.23 
 
 		 224 aa  53.9  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.147143  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.06 
 
 		 444 aa  53.9  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.18 
 
 		 334 aa  54.3  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  24.15 
 
 		 357 aa  53.9  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.15 
 
 		 357 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.12 
 
 		 368 aa  53.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0759  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  27.53 
 
 		 356 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.939096  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1007  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.6 
 
 		 181 aa  53.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0886  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.68 
 
 		 233 aa  53.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>