88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0392 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0392  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  969    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0332  hypothetical protein  58.8 
 
 		 457 aa  565  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0384  hypothetical protein  58.8 
 
 		 477 aa  561  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5534  polyferredoxin-like  57.99 
 
 		 465 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3801  hypothetical protein  62.44 
 
 		 477 aa  551  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0435809  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2230  polyferredoxin-like protein  58.57 
 
 		 465 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2206  polyferredoxin-like protein  58.35 
 
 		 465 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5871  polyferredoxin-like  58.35 
 
 		 465 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4288  hypothetical protein  58.26 
 
 		 471 aa  547  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0607453  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3630  hypothetical protein  56.9 
 
 		 474 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00502149 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2032  hypothetical protein  57.24 
 
 		 466 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2123  polyferredoxin-like protein  57.24 
 
 		 465 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.334313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2244  polyferredoxin-like protein  57.24 
 
 		 465 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1954  putative nitrogen fixation protein VnfA  55.31 
 
 		 469 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1071  polyferredoxin-like protein  57.02 
 
 		 465 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1400  putative nitrogen fixation protein VnfA  55.21 
 
 		 464 aa  526  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11103  normal  0.0950642 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0609  hypothetical protein  56.02 
 
 		 466 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398547  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0511  hypothetical protein  56.02 
 
 		 466 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3149  putative nitrogen fixation protein VnfA  54.99 
 
 		 468 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.604637  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1924  nitrogen fixation protein VnfA  56.02 
 
 		 466 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0911  hypothetical protein  55.58 
 
 		 466 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0011  hypothetical protein  55.58 
 
 		 466 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0884  hypothetical protein  55.58 
 
 		 466 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1743  hypothetical protein  55.58 
 
 		 466 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0676107  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3606  nitrogen fixation protein VnfA  55.11 
 
 		 461 aa  472  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.331622  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1109  putative regulatory protein  47.33 
 
 		 463 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.414253  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2352  polyferredoxin-like protein  40.09 
 
 		 438 aa  315  9e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0428  hypothetical protein  43.44 
 
 		 440 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2084  hypothetical protein  47.12 
 
 		 440 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3683  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.7 
 
 		 476 aa  87.8  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3534  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.613283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0745  cyclic nucleotide-binding protein  30.53 
 
 		 837 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.274315  normal  0.0506496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3536  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.99 
 
 		 841 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3607  cyclic nucleotide-binding protein  30.7 
 
 		 841 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.29767 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2488  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.51 
 
 		 462 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  22.31 
 
 		 918 aa  70.5  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1371  polyferredoxin-like protein  23.04 
 
 		 474 aa  68.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1527  nitrogen assimilation regulatory protein  30.24 
 
 		 838 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360333 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29251  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  27 
 
 		 695 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1656  hypothetical protein  31.72 
 
 		 452 aa  67.4  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3170  cyclic nucleotide-binding protein  24.9 
 
 		 785 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0158223  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07620  4Fe-4S protein  30.11 
 
 		 292 aa  63.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.49628 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2565  sigma-54 factor  33.72 
 
 		 662 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.289153  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.62 
 
 		 357 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  23.62 
 
 		 357 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  24.02 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  24.02 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.02 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.02 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  25.99 
 
 		 860 aa  61.6  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1993  hypothetical protein  22.33 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  23.23 
 
 		 357 aa  59.7  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.23 
 
 		 357 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.58 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1451  cyclic nucleotide-binding protein  29.29 
 
 		 516 aa  57.4  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.6 
 
 		 368 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.13 
 
 		 368 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.16 
 
 		 290 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0621  quinol dehydrogenase membrane component  27.43 
 
 		 298 aa  52.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3247  hypothetical protein  25.75 
 
 		 463 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1723  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  26.06 
 
 		 299 aa  50.4  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0702  quinol dehydrogenase membrane component  24.57 
 
 		 332 aa  50.4  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.63 
 
 		 347 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191107  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3959  quinol dehydrogenase membrane component  26.7 
 
 		 302 aa  49.7  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.041404 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0806  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.58 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0103679  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2985  quinol dehydrogenase membrane component  30.16 
 
 		 303 aa  48.9  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3320  quinol dehydrogenase membrane component  23.43 
 
 		 327 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  23.56 
 
 		 857 aa  49.3  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3150  quinol dehydrogenase membrane component  25.13 
 
 		 323 aa  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413513  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3432  quinol dehydrogenase membrane component  24 
 
 		 327 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0970703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.9 
 
 		 216 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614273  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0846  quinol dehydrogenase membrane component  22.58 
 
 		 319 aa  47.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3208  quinol dehydrogenase membrane component  24.57 
 
 		 299 aa  47.8  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1565  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  26.07 
 
 		 327 aa  47.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0341638  normal  0.420603 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.12 
 
 		 356 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.232624  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1739  regulatory protein NosR  23.26 
 
 		 715 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0798  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.76 
 
 		 356 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223587  hitchhiker  0.00276018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.4 
 
 		 404 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0759  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  24.22 
 
 		 356 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.939096  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1742  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.67 
 
 		 298 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  normal  0.0170059 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4220  FMN-binding domain-containing protein  26.05 
 
 		 726 aa  44.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1409  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.2 
 
 		 257 aa  44.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20230  regulatory protein NosR  22.79 
 
 		 715 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578726 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0578  hypothetical protein  22.22 
 
 		 386 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.746037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.04 
 
 		 325 aa  43.9  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.856458  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1304  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  21.51 
 
 		 301 aa  43.9  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000969125  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2563  FMN-binding domain protein  21.76 
 
 		 714 aa  43.5  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.132297  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0446  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  23.35 
 
 		 298 aa  43.5  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>