More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1723 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1723  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  100 
 
 
299 aa  608  1e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0668  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  80 
 
 
300 aa  502  1e-141  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0446  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  58.86 
 
 
298 aa  371  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1304  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  52.96 
 
 
301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000969125  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1565  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  43.59 
 
 
327 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0341638  normal  0.420603 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3959  quinol dehydrogenase membrane component  32.45 
 
 
302 aa  169  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.041404 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1930  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  34.88 
 
 
263 aa  159  6e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.019588  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3208  quinol dehydrogenase membrane component  35.74 
 
 
299 aa  159  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0621  quinol dehydrogenase membrane component  33.84 
 
 
298 aa  158  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4007  quinol dehydrogenase membrane component  35.04 
 
 
311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0846  quinol dehydrogenase membrane component  35.57 
 
 
319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3163  quinol dehydrogenase membrane component  34.84 
 
 
302 aa  152  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1589  periplasmic nitrate reductase subunit NapH  32.43 
 
 
285 aa  152  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0440  quinol dehydrogenase membrane component  32.69 
 
 
292 aa  149  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255918  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0702  quinol dehydrogenase membrane component  33.99 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3320  quinol dehydrogenase membrane component  34.39 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159981  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1058  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  30.5 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3432  quinol dehydrogenase membrane component  33.99 
 
 
327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0970703  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3150  quinol dehydrogenase membrane component  36.76 
 
 
323 aa  145  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413513  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07620  4Fe-4S protein  33.89 
 
 
292 aa  144  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.49628 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3838  quinol dehydrogenase membrane component  32.93 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.497942  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1516  quinol dehydrogenase membrane component  33.33 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000106423  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2985  quinol dehydrogenase membrane component  31.82 
 
 
303 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1341  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  33.6 
 
 
281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0726  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  32.43 
 
 
279 aa  138  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000359603  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0873  quinol dehydrogenase membrane component  34.25 
 
 
259 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0803  quinol dehydrogenase membrane component  34.25 
 
 
259 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113023  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1016  quinol dehydrogenase membrane component  36.43 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2717  quinol dehydrogenase membrane component  33.46 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3220  quinol dehydrogenase membrane component  32.57 
 
 
302 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1506  quinol dehydrogenase membrane component  27.05 
 
 
290 aa  133  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0556  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  29.62 
 
 
287 aa  132  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0555  periplasmic nitrate reductase subunit NapH  30.65 
 
 
283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2413  quinol dehydrogenase membrane component  34.11 
 
 
287 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1718  quinol dehydrogenase membrane component  30.12 
 
 
261 aa  125  6e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1742  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.67 
 
 
298 aa  125  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  normal  0.0170059 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2441  quinol dehydrogenase membrane component  29.91 
 
 
289 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.437001 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2497  quinol dehydrogenase membrane component  29.91 
 
 
289 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02131  quinol dehydrogenase membrane component  31.02 
 
 
287 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.217114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1455  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  31.02 
 
 
287 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2342  quinol dehydrogenase membrane component  31.02 
 
 
287 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3341  quinol dehydrogenase membrane component  31.02 
 
 
287 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.820241  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02090  hypothetical protein  31.02 
 
 
287 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182907  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2600  quinol dehydrogenase membrane component  29.49 
 
 
289 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.419201 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2503  quinol dehydrogenase membrane component  31.02 
 
 
287 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2352  quinol dehydrogenase membrane component  31.02 
 
 
287 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1159  quinol dehydrogenase membrane component  30.8 
 
 
261 aa  124  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.239139  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1446  quinol dehydrogenase membrane component  31.02 
 
 
287 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0866  putative permease  35.38 
 
 
263 aa  123  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0737  quinol dehydrogenase membrane component  30.61 
 
 
287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1290  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.47 
 
 
470 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4738  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  31.03 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199937  normal  0.474351 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001238  polyferredoxin NapH (periplasmic nitrate reductase)  27.31 
 
 
284 aa  113  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.57 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.55 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0712  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.27 
 
 
325 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000841077  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3335  Iron-sulfur cluster-binding protein  28.36 
 
 
354 aa  77  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.45 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  24.45 
 
 
357 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  24.02 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.02 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  24.02 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08480  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.94 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.02 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.02 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.02 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  24.02 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.02 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.32 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1000  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.91 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2067  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.91 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0832  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.43 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148758  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.24 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3015  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.38 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1785  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.23 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20230  regulatory protein NosR  30.77 
 
 
715 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.578726 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.74 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614273  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1081  hypothetical protein  30.53 
 
 
205 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.19 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.856458  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1390  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  29.44 
 
 
884 aa  68.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.72 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0666  polyferredoxin-like protein  24.48 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201156  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.523499  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2486  FMN-binding domain-containing protein  28.95 
 
 
681 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1904  iron-sulfur cluster-binding protein  27.23 
 
 
346 aa  67  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000493805  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0798  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.42 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223587  hitchhiker  0.00276018 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  28.27 
 
 
480 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  31.21 
 
 
572 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1059  FMN-binding domain protein  31.25 
 
 
873 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602709  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1138  FMN-binding domain-containing protein  31.25 
 
 
873 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599326  normal  0.568737 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3181  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  28.28 
 
 
687 aa  64.7  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.333663  normal  0.835049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1739  regulatory protein NosR  29.49 
 
 
715 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.71 
 
 
347 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191107  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.2 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1904  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.5 
 
 
228 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000083594  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0751  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.32 
 
 
328 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0839232  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1973  riboflavin biosynthesis protein ribAB  24.76 
 
 
270 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.220327  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.92 
 
 
334 aa  63.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1482  FMN-binding domain-containing protein  33.12 
 
 
886 aa  63.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>