121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1993 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1993  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  925    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  36.34 
 
 
918 aa  329  7e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1371  polyferredoxin-like protein  35.2 
 
 
474 aa  326  6e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3683  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.11 
 
 
476 aa  92.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3536  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.8 
 
 
841 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3291  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.43 
 
 
470 aa  77.8  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00624459  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3534  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.27 
 
 
476 aa  77.4  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.613283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3607  cyclic nucleotide-binding protein  27.84 
 
 
841 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.29767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0745  cyclic nucleotide-binding protein  26.98 
 
 
837 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.274315  normal  0.0506496 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3170  cyclic nucleotide-binding protein  27.09 
 
 
785 aa  70.1  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0158223  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2488  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.4 
 
 
462 aa  70.1  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1527  nitrogen assimilation regulatory protein  29.25 
 
 
838 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000360333 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3247  hypothetical protein  25.88 
 
 
463 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0884  hypothetical protein  24.74 
 
 
466 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1924  nitrogen fixation protein VnfA  24.74 
 
 
466 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1743  hypothetical protein  24.74 
 
 
466 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0676107  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0011  hypothetical protein  24.74 
 
 
466 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0911  hypothetical protein  24.74 
 
 
466 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0609  hypothetical protein  24.74 
 
 
466 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398547  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29251  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  24.91 
 
 
695 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0511  hypothetical protein  24.74 
 
 
466 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1400  putative nitrogen fixation protein VnfA  23.14 
 
 
464 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11103  normal  0.0950642 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2032  hypothetical protein  24.52 
 
 
466 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1656  hypothetical protein  22.02 
 
 
452 aa  64.3  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2565  sigma-54 factor  27.86 
 
 
662 aa  63.9  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.289153  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1451  cyclic nucleotide-binding protein  23.7 
 
 
516 aa  62.8  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0384  hypothetical protein  20.55 
 
 
477 aa  61.6  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1109  putative regulatory protein  23.19 
 
 
463 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.414253  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5534  polyferredoxin-like  23.46 
 
 
465 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2244  polyferredoxin-like protein  23.46 
 
 
465 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2230  polyferredoxin-like protein  26.02 
 
 
465 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5871  polyferredoxin-like  25.1 
 
 
465 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2206  polyferredoxin-like protein  25.1 
 
 
465 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0332  hypothetical protein  23.83 
 
 
457 aa  61.6  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1071  polyferredoxin-like protein  23.87 
 
 
465 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2123  polyferredoxin-like protein  23.46 
 
 
465 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.334313  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3630  hypothetical protein  25.1 
 
 
474 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00502149 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0392  hypothetical protein  22.33 
 
 
484 aa  60.5  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3606  nitrogen fixation protein VnfA  20.77 
 
 
461 aa  60.1  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.331622  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3149  putative nitrogen fixation protein VnfA  23.77 
 
 
468 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.604637  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  23.45 
 
 
857 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1954  putative nitrogen fixation protein VnfA  25.51 
 
 
469 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285515  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.13 
 
 
404 aa  55.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4288  hypothetical protein  21.13 
 
 
471 aa  54.7  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0607453  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3801  hypothetical protein  23.23 
 
 
477 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0435809  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  26.11 
 
 
860 aa  54.3  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0469  hypothetical protein  22.34 
 
 
619 aa  53.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0428  hypothetical protein  22.67 
 
 
440 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2084  hypothetical protein  22.67 
 
 
440 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2352  polyferredoxin-like protein  22.92 
 
 
438 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.4 
 
 
357 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.79 
 
 
404 aa  51.2  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000637603 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.37 
 
 
444 aa  51.6  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.18 
 
 
240 aa  51.2  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.523499  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0798  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.84 
 
 
356 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223587  hitchhiker  0.00276018 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.4 
 
 
357 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  25.4 
 
 
357 aa  50.4  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0616  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  22.42 
 
 
331 aa  50.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000698811  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2371  iron-sulfur cluster-binding protein  30.43 
 
 
277 aa  50.1  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000206096  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  25 
 
 
357 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  25 
 
 
357 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0446  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  26.42 
 
 
298 aa  49.7  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0668  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  25 
 
 
300 aa  49.7  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25 
 
 
357 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25 
 
 
357 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0314  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.03 
 
 
404 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.55 
 
 
288 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.51 
 
 
368 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  24.59 
 
 
357 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1277  iron-sulfur binding protein  26.8 
 
 
438 aa  49.3  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000111137  normal  0.38005 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0315  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.03 
 
 
404 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1960  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.53 
 
 
247 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0307  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.13 
 
 
415 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.161292 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3116  iron-sulfur cluster-binding protein  26.54 
 
 
316 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.03 
 
 
404 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1973  riboflavin biosynthesis protein ribAB  26.29 
 
 
270 aa  48.9  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.220327  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.67 
 
 
331 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2604  iron-sulfur cluster-binding protein  25 
 
 
339 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1329  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.79 
 
 
645 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.2343  normal  0.019579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.38 
 
 
351 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0311  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.35 
 
 
404 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0463  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.34 
 
 
294 aa  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1482  FMN-binding domain-containing protein  22.39 
 
 
886 aa  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3549  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.74 
 
 
404 aa  47.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3153  iron-sulfur cluster-binding protein  27.42 
 
 
335 aa  47  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.758597  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.56 
 
 
334 aa  47  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3053  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  25.52 
 
 
272 aa  47  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4404  iron-sulfur cluster-binding protein  29.13 
 
 
375 aa  47  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1957  iron-sulfur cluster-binding protein  30.23 
 
 
290 aa  46.6  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.5 
 
 
290 aa  47  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0576  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.24 
 
 
258 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0806  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.31 
 
 
358 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0103679  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0297  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  31.65 
 
 
335 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.012248  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0312  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.13 
 
 
415 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3712  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.13 
 
 
415 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0416  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.23 
 
 
404 aa  46.6  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.7 
 
 
356 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.232624  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0216  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  24.77 
 
 
334 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.417368  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1409  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.88 
 
 
257 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6007  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  25.12 
 
 
764 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>