84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1954 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2123  polyferredoxin-like protein  79.96 
 
 		 465 aa  758    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.334313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1954  putative nitrogen fixation protein VnfA  100 
 
 		 469 aa  947    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2206  polyferredoxin-like protein  77.8 
 
 		 465 aa  734    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1400  putative nitrogen fixation protein VnfA  85.71 
 
 		 464 aa  805    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11103  normal  0.0950642 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2244  polyferredoxin-like protein  79.53 
 
 		 465 aa  754    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5871  polyferredoxin-like  77.8 
 
 		 465 aa  734    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3149  putative nitrogen fixation protein VnfA  86.91 
 
 		 468 aa  824    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.604637  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2032  hypothetical protein  82.33 
 
 		 466 aa  771    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0911  hypothetical protein  83.19 
 
 		 466 aa  757    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1743  hypothetical protein  83.19 
 
 		 466 aa  757    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0676107  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1071  polyferredoxin-like protein  81.03 
 
 		 465 aa  749    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5534  polyferredoxin-like  79.53 
 
 		 465 aa  747    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1924  nitrogen fixation protein VnfA  83.01 
 
 		 466 aa  761    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2230  polyferredoxin-like protein  78.02 
 
 		 465 aa  737    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0511  hypothetical protein  83.19 
 
 		 466 aa  759    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0011  hypothetical protein  83.19 
 
 		 466 aa  757    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0884  hypothetical protein  83.19 
 
 		 466 aa  757    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0609  hypothetical protein  82.97 
 
 		 466 aa  755    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398547  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3606  nitrogen fixation protein VnfA  62.09 
 
 		 461 aa  546  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.331622  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4288  hypothetical protein  55.19 
 
 		 471 aa  521  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0607453  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0332  hypothetical protein  54.68 
 
 		 457 aa  513  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0384  hypothetical protein  53.86 
 
 		 477 aa  511  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3801  hypothetical protein  54.49 
 
 		 477 aa  511  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0435809  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0392  hypothetical protein  55.31 
 
 		 484 aa  509  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3630  hypothetical protein  51.08 
 
 		 474 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00502149 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1109  putative regulatory protein  48.58 
 
 		 463 aa  443  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.414253  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2352  polyferredoxin-like protein  39.01 
 
 		 438 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0428  hypothetical protein  42.26 
 
 		 440 aa  260  4e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2084  hypothetical protein  43.83 
 
 		 440 aa  257  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  26.57 
 
 		 918 aa  84  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3534  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.29 
 
 		 476 aa  79.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.613283 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3683  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29 
 
 		 476 aa  76.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2488  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  20.99 
 
 		 462 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3536  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.05 
 
 		 841 aa  75.1  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0745  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 837 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.274315  normal  0.0506496 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1656  hypothetical protein  25.61 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3607  cyclic nucleotide-binding protein  27.62 
 
 		 841 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.29767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  26.07 
 
 		 860 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1527  nitrogen assimilation regulatory protein  29.05 
 
 		 838 aa  66.6  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360333 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2565  sigma-54 factor  26.89 
 
 		 662 aa  65.1  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.289153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29251  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  27.62 
 
 		 695 aa  64.7  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3247  hypothetical protein  27.05 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1993  hypothetical protein  25.51 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3170  cyclic nucleotide-binding protein  24.59 
 
 		 785 aa  57  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0158223  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  25.91 
 
 		 857 aa  57  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1371  polyferredoxin-like protein  20.66 
 
 		 474 aa  56.6  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  22.13 
 
 		 357 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  21.88 
 
 		 357 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.13 
 
 		 357 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.13 
 
 		 357 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  22.13 
 
 		 357 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  21.88 
 
 		 357 aa  55.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  21.48 
 
 		 357 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.88 
 
 		 357 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07620  4Fe-4S protein  25.11 
 
 		 292 aa  53.5  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.49628 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0578  hypothetical protein  24.89 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.746037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.48 
 
 		 357 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1723  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  25.63 
 
 		 299 aa  52.4  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1451  cyclic nucleotide-binding protein  23.99 
 
 		 516 aa  50.8  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.48 
 
 		 216 aa  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614273  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1206  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.57 
 
 		 260 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1277  iron-sulfur binding protein  24.42 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000111137  normal  0.38005 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2253  FMN-binding domain-containing protein  27.6 
 
 		 703 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1960  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.77 
 
 		 247 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3079  FMN-binding domain-containing protein  25.38 
 
 		 714 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0668  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  22 
 
 		 300 aa  46.6  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  20.87 
 
 		 290 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3193  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  25.13 
 
 		 728 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  24.69 
 
 		 480 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4220  FMN-binding domain-containing protein  26.18 
 
 		 726 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1589  periplasmic nitrate reductase subunit NapH  27.42 
 
 		 285 aa  45.8  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20230  regulatory protein NosR  24.62 
 
 		 715 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578726 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.86 
 
 		 273 aa  45.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2563  FMN-binding domain protein  22.11 
 
 		 714 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.132297  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0621  quinol dehydrogenase membrane component  28.25 
 
 		 298 aa  45.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.75 
 
 		 351 aa  44.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  21.85 
 
 		 368 aa  44.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1785  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.85 
 
 		 307 aa  44.3  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1739  regulatory protein NosR  25.52 
 
 		 715 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25 
 
 		 347 aa  44.3  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191107  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0686  regulator of nitric oxide reductase transcription  29.41 
 
 		 696 aa  43.9  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0382945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6007  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  26.73 
 
 		 764 aa  43.9  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0601  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  20.72 
 
 		 431 aa  43.9  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0545044 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1482  FMN-binding domain-containing protein  28.19 
 
 		 886 aa  43.9  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>